典型文献
猪瘟活疫苗(兔源)免疫猪体后血液转录组学变化初探
文献摘要：
为了研究猪瘟活疫苗(兔源)免疫猪体后的免疫应答,本试验选择未免疫猪瘟疫苗且猪瘟抗原抗体阴性的4周龄小猪10头,随机分成2个组别,分别免疫猪瘟活疫苗(兔源)、健康家兔脾淋组织(组织对照),采集免疫后3 d的前腔静脉血液样本,利用RNA-Seq技术进行转录组测序分析,并采用荧光定量PCR(RT-qPCR)方法验证.结果表明:猪瘟活疫苗(兔源)免疫组与脾淋组织对照组相比,外周血中差异表达基因有317个(P<0.05),其中上调表达的基因数量为221个,下调表达的有96个;差异基因GO功能富集分析显示,与生物过程相关的有483个,细胞组分相关的98个,分子功能相关的有87个,其中显著差异转录的mRNA主要参与对病毒的防御反应(defense response to virus)、病毒过程(viral process)等生物过程;KEGG信号通路富集分析表明,涉及的通路数量有215个,与免疫和抗炎相关的有甲型流感(Infl uenza A)、EB病毒感染(Epstein-Barr virus infection)、RIG-I样受体(RIG-I-like receptor signaling pathway)、TNF信号通路(TNF signaling pathway)、NOD-like受体信号通路(NOD-like receptor signaling pathway)等,其中CXCL10、RSAD2、OAS1、OAS2、MX1、ISG15等基因上调表达;随机筛选了CXCL10、NOS3、CD86、NOD14个差异表达基因进行RT-qPCR验证,结果显示RT-qPCR和测序结果间的差异表达基因趋势基本一致,说明猪瘟活疫苗(兔源)免疫3 d可刺激猪体先天性免疫应答.
文献关键词：
猪瘟活疫苗(兔源);RNA-seq;血液;GO功能富集分析;KEGG信号通路分析
中图分类号：
作者姓名：
包松英;庄许诺;江兴华;王全溪
作者机构：
兆丰华生物科技(福州)有限公司,福州350014;福建农林大学 福建省兽医中药与动物保健重点实验室,福州 350002;福建农林大学 中西兽医结合与动物保健福建省高等学校重点实验室,福州 350002
文献出处：
引用格式：
[1]包松英;庄许诺;江兴华;王全溪-.猪瘟活疫苗(兔源)免疫猪体后血液转录组学变化初探)[J].中国动物传染病学报,2022(02):48-55
A类：
兔脾淋组织,Infl,uenza,NOD14
B类：
猪瘟活疫苗,兔源,血液转录组,转录组学,免疫应答,未免,猪瘟疫苗,抗原抗体,周龄,小猪,组别,家兔,腔静脉,血液样本,Seq,转录组测序分析,qPCR,方法验证,差异表达基因,差异基因,功能富集分析,生物过程,防御反应,defense,response,virus,viral,process,信号通路富集,通路富集分析,路数,甲型流感,EB,Epstein,Barr,infection,RIG,样受体,like,receptor,signaling,pathway,CXCL10,RSAD2,OAS1,OAS2,MX1,ISG15,NOS3,CD86,先天性免疫,seq,通路分析
AB值：
0.331776
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