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O型口蹄疫兔化弱毒YNTBa株感染的牛原代睾丸细胞基因表达分析
文献摘要：
为分析口蹄疫病毒(foot-and-mouth disease virus,FMDV)减毒株感染天然宿主细胞后基因表达变化,将O型FMDV兔化弱毒株YNTBa接种初生犊牛原代睾丸细胞(BT),采用二代测序技术对YNTBa感染BT细胞后8 h和24 h的细胞转录组进行研究.结果显示:病毒感染8 h和24h的试验组较对照组分别筛选出437和134个表达变化≥2倍的差异表达基因.基因本体论(GO)功能类聚分析显示,差异表达基因主要参与到细胞分化、DNA转录、细胞因子产生和凋亡等.京都基因与基因组百科全书(KEGG)功能富聚分析表明,差异表达基因主要与细胞代谢、核糖体、吞噬体、蛋白消化吸收、细胞分化、细胞转录调控等相关,涉及糖基化终末产物受体(AGE-RAGE)、肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素17(IL-17)、转化生长因子β(TGF-β)、磷脂酰肌醇-3-激酶/蛋白激酶B(PI3K-Akt)、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)、促性腺激素释放激素(GnRH)、雌性激素(estrogen)和催产素(oxytocin)等多条信号通路.利用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)验证了其中12个差异表达基因,定量结果与转录组测序结果一致.本研究筛选的差异表达基因为进一步了解FMDV弱毒免疫机制,包括FMDV复制相关基因提供了基础.
文献关键词：
O型口蹄疫病毒;减毒株;转录组分析;差异表达基因
中图分类号：
作者姓名：
汤雅淇;普娅芸;李珂;高华峰;何于雯;王生奎;信爱国
作者机构：
云南农业大学动物医学院,云南昆明 650224;云南省畜牧兽医科学院国家口蹄疫专业实验室(昆明)/云南省热带亚热带动物病毒病重点实验室,云南昆明 650224
文献出处：
引用格式：
[1]汤雅淇;普娅芸;李珂;高华峰;何于雯;王生奎;信爱国-.O型口蹄疫兔化弱毒YNTBa株感染的牛原代睾丸细胞基因表达分析)[J].畜牧与兽医,2022(10):89-96
A类：
YNTBa
B类：
原代,睾丸,基因表达分析,口蹄疫病毒,foot,mouth,disease,virus,FMDV,减毒株,宿主,主细胞,表达变化,初生犊牛,BT,二代测序技术,24h,差异表达基因,基因本体论,类聚,细胞分化,京都基因与基因组百科全书,细胞代谢,核糖体,吞噬体,消化吸收,转录调控,糖基化终末产物受体,RAGE,转化生长因子,TGF,磷脂酰肌醇,PI3K,Akt,丝裂原活化蛋白激酶,MAPK,促性腺激素释放激素,GnRH,雌性激素,estrogen,催产素,oxytocin,多条,qPCR,转录组测序,免疫机制,转录组分析
AB值：
0.306436
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