典型文献
番鸭羽色性状相关差异表达基因的转录组对比分析
文献摘要：
为进一步研究番鸭羽色性状的遗传机制,运用Illumina高通量测序技术对黑羽及白羽番鸭皮肤组织进行转录组测序(RNA-seq),利用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)对部分RNA-seq数据进行验证后,经基因本体(GO)富集分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路注释以及蛋白互作网络数据库(STRING)对差异表达基因功能进行筛选和功能分析.结果显示:RT-qPCR验证结果与RNA-seq结果比对,差异表达基因变化趋势一致,黑羽番鸭与白羽番鸭皮肤中发现显著差异表达基因684个,其中上调差异表达基因362个,下调差异表达基因322个,进一步筛选获得番鸭羽色性状相关候选差异表达基因20个,其中溶质载体家族24成员4(SLC24A4)、SLC24A5、酪氨酸酶相关蛋白1(TYRP1)、多巴色素异构酶(DCT)、溶质载体家族7成员11(SLC7A11)和小眼畸形相关转录因子(MITF)可能对番鸭羽色的遗传调控起重要调控作用.试验结果丰富了番鸭羽色性状遗传机制的研究,并为番鸭的进一步选育提供了新的数据支撑.
文献关键词：
番鸭;羽色;皮肤;转录组测序
中图分类号：
作者姓名：
段修军;孙国波;张蕾;陆艳凤;王丽华;田培余;张卫明
作者机构：
江苏农牧科技职业学院,江苏泰州 225300
文献出处：
引用格式：
[1]段修军;孙国波;张蕾;陆艳凤;王丽华;田培余;张卫明-.番鸭羽色性状相关差异表达基因的转录组对比分析)[J].畜牧与兽医,2022(10):12-18
A类：
SLC24A4
B类：
羽色,差异表达基因,遗传机制,Illumina,高通量测序技术,鸭皮,皮肤组织,转录组测序,seq,qPCR,基因本体,富集分析,京都基因与基因组百科全书,蛋白互作网络,网络数据库,STRING,基因功能,功能分析,结果比对,黑羽番鸭,调差,溶质载体,SLC24A5,酪氨酸酶,TYRP1,多巴色素,异构酶,DCT,SLC7A11,小眼畸形,形相,MITF,遗传调控,性状遗传,选育
AB值：
0.29473
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