典型文献
基于转录组测序筛选高盐培养下双峰驼肾皮质细胞差异表达基因
文献摘要:
为探讨双峰驼的高盐适应机制并筛选出受高盐调控的基因,本试验采用RNA-Seq技术对双峰驼肾皮质细胞进行转录组测序分析.试验分为2个组,等渗培养基处理的肾皮质细胞为对照组(Control),高渗培养基处理的肾皮质细胞为高渗组(HS),进行转录组测序,从而筛选出一系列差异表达基因(DEGs),并用GO富集和KEGG富集分析对DEGs进行基因功能和途径的注释.结果显示,在高盐环境下双峰驼肾皮质细胞中共有4 854个显著DEGs;GO富集分析显示,DEGs显著富集在G蛋白偶联受体活性、受体结合、核酸结合转录因子活性、质膜、离子通道的活动和免疫反应等功能中;KEGG通路富集显示,DEGs显著富集在信号传导、辅助因子和维生素代谢、信号分子相互作用、运输和分解代谢、免疫系统等通路中;采用实时荧光定量PCR技术随机检测了参与高盐代谢的3个差异表达基因,其表达趋势与RNA-Seq 一致,可以验证RNA-Seq技术的准确性.因此,双峰驼肾皮质细胞的高盐耐受性可能与这些途径和通路中重要基因的调控有关.本试验结果将为进一步揭示双峰驼耐盐性的分子调控机制提供重要的参考依据.
文献关键词:
高盐;双峰驼;肾皮质细胞;转录组测序;差异表达基因
中图分类号:
作者姓名:
陈丽慧;萨日娜;宝山;敖特根巴雅尔;朝鲁门格日乐;黄海峰;孙波;额尔敦木图;杨彬
作者机构:
内蒙古农业大学兽医学院,内蒙古呼和浩特010018;阿拉善盟动物卫生监督所,内蒙古巴彦浩特750306;内蒙古自治区巴彦淖尔市农牧业科学研究所,内蒙古巴彦淖尔015000;鄂托克旗农牧局动物疫病预防控制中心,内蒙古鄂尔多斯016100;阿拉善左旗农牧区生态管理综合行政执法局,内蒙古巴彦浩特750300;内蒙古阿拉善左旗巴润别立镇综合保障和技术推广中心,内蒙古巴彦浩特750300
文献出处:
引用格式:
[1]陈丽慧;萨日娜;宝山;敖特根巴雅尔;朝鲁门格日乐;黄海峰;孙波;额尔敦木图;杨彬-.基于转录组测序筛选高盐培养下双峰驼肾皮质细胞差异表达基因)[J].中国兽医杂志,2022(03):1-8,14
A类:
肾皮质细胞
B类:
双峰驼,差异表达基因,适应机制,Seq,转录组测序分析,Control,HS,DEGs,富集分析,基因功能,高盐环境,偶联,质膜,离子通道,免疫反应,通路富集,信号传导,辅助因子,信号分子,分子相互作用,分解代谢,免疫系统,耐受性,耐盐性,分子调控机制
AB值:
0.156312
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