典型文献
谷子miR169家族及其靶基因的鉴定与功能分析
文献摘要：
microRNA广泛参与植物中多个生长发育过程,miR169家族是最保守的miRNA家族之一.对谷子miR169(sit-miR169)家族进行生物信息学分析,包括染色体分布、系统进化、碱基保守性、二级结构和sit-miR169及其靶基因的表达.鉴定了 15个sit-miR169,分布于7条染色体上.系统进化分析显示,sit-miR169家族前体sit-MIR169大致可以分为2簇,部分sit-MIR169成员与水稻osa-MIR169家族成员亲缘关系较近.sit-miR169的前体均可形成稳定的二级茎环结构,成熟体均产生于前体的5'端臂上,且成熟序列的碱基保守性很强.sit-miR169在花、叶和根中均有表达,具有明显组织表达特异性.sit-miR169的靶基因主要是NF-YA转录因子基因,此外还有L型凝集素类受体蛋白激酶、ω-6脂肪酸去饱和酶、转运蛋白Sec1a、SDG40蛋白、环指跨膜蛋白和核糖体大亚基假尿苷合酶SVR1基因等.miR169通过调控靶基因,尤其是NF-YA的表达量来影响植物的生长发育和对环境的应答.谷子NF-YA基因主要在根和穗中表达,表现出明显的组织表达特异性.此外,sit-miR169靶基因的表达受环境诱导,如干旱条件能进一步诱导Seita.9G521100基因在根中的表达.
文献关键词：
谷子;miRNA;miR169;靶基因;生物信息学
中图分类号：
作者姓名：
卢平;康庆芳;赵孟瑶;张凤洁;武强强;马芳芳;王宇珅;韩渊怀;王兴春;李雪垠
作者机构：
山西农业大学生命科学学院,030801,山西晋中;山西农业大学农学院,030801,山西晋中
文献出处：
引用格式：
[1]卢平;康庆芳;赵孟瑶;张凤洁;武强强;马芳芳;王宇珅;韩渊怀;王兴春;李雪垠-.谷子miR169家族及其靶基因的鉴定与功能分析)[J].作物杂志,2022(02):54-63
A类：
MIR169,osa,Sec1a,SDG40,SVR1,9G521100
B类：
谷子,miR169,功能分析,microRNA,miRNA,sit,生物信息学分析,碱基,保守性,二级结构,系统进化分析,水稻,亲缘关系,茎环结构,叶和根,组织表达,达特,YA,凝集素,类受体蛋白激酶,去饱和,转运蛋白,跨膜蛋白,核糖体,亚基,假尿苷,调控靶基因,环境诱导,Seita
AB值：
0.230114
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