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典型文献
向日葵LACS家族鉴定及响应非生物胁迫表达分析
文献摘要:
利用生物信息学技术从向日葵(Helianthus annuus)基因组中鉴定了13个长链酰基辅酶A合成酶(long-chain acyl-CoA synthases,LACSs)家族基因,其分布在向日葵8条染色体上.系统发育树显示,HaLACS家族成员分为6个亚族,且同一亚族成员具有相似的基因结构和蛋白保守基序.基因复制分析发现HaLACS家族扩增的主要因素是片段复制.HaLACS的启动子区域富含逆境响应和植物激素调控相关元件.表达谱分析显示HaLA CS在向日葵不同组织中的表达存在差异.比较2个向日葵品种(高/低亚油酸含量)中HaLACS在种子发育不同阶段的表达,HaLACS呈现差异表达.qRT-PCR结果表明,200 mmol·L-1 NaCl处理24 h后,7个HaLACS在茎中的表达量与同期对照相比显著上调;100 μmol·L-1 ABA处理3h后,8个HaLACS在根中的表达量显著上调;15% PEG 6000模拟干旱胁迫后,多数HaLACS在不同组织中呈现诱导表达.综上,向日葵LACS基因家族不仅参与了向日葵脂质的合成,而且在应对非生物胁迫时发挥重要作用.
文献关键词:
向日葵;LACS基因家族;非生物胁迫;基因表达
作者姓名:
周至铭;杨佳宝;张程;曾令露;孟晚秋;孙黎
作者机构:
石河子大学生命科学学院,新疆石河子832003
文献出处:
引用格式:
[1]周至铭;杨佳宝;张程;曾令露;孟晚秋;孙黎-.向日葵LACS家族鉴定及响应非生物胁迫表达分析)[J].园艺学报,2022(02):352-364
A类:
LACSs,HaLACS,HaLA
B类:
非生物胁迫,表达分析,利用生物,生物信息学技术,Helianthus,annuus,长链,酰基,基辅,辅酶,合成酶,long,chain,acyl,CoA,synthases,家族基因,系统发育树,基因结构,保守基序,基因复制,启动子区域,逆境响应,植物激素,激素调控,关元,表达谱分析,不同组织,向日葵品种,亚油酸,油酸含量,种子发育,差异表达,qRT,NaCl,ABA,3h,PEG,干旱胁迫,诱导表达,基因家族
AB值:
0.339219
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