典型文献
蓖麻miR396基因家族及其靶基因GRF生物信息学分析及鉴定
文献摘要：
MiR396-GRF在调控植物的生长发育和生物胁迫及非生物胁迫过程中发挥着重要作用,目前关于蓖麻miR396和GRF的研究还很少.本研究中利用BLASTP和Pfam在蓖麻基因组中鉴定到4个miR396和11个GRF成员.分析发现,RcGRFs转录因子蛋白长度在318-619aa之间,理论等电点在5.54-9.34之间,分子量最小为35179.57 Da,最大值则为67639.97 Da.保守结构域和基序分析发现,所有RcGRFs均包含QLQ和WRC保守结构域.系统进化分析发现,RcGRFs在进化上与同样是双子叶植物的大豆、木薯、毛果杨存在着相似的进化模式,并且通过对RcmiR396与RcGRFs作用位点的分析发现,所有的RcGRFs均包含RcmiR396靶位点,并大部分位于外显子和3'UTR区.一些RcGRF具有组织表达特异性,因此,RcmiR396与RcGRF可能相互作用,调节蓖麻生长发育的不同阶段.
文献关键词：
蓖麻;miR396;GRF;表达分析
中图分类号：
作者姓名：
邢海彦;唐杰松;于耸;郑志民
作者机构：
东北林业大学生命科学学院,东北盐碱植被恢复与重建教育部重点实验室,黑龙江哈尔滨,150040;东北林业大学林学院,林木遗传育种国家重点实验室,黑龙江哈尔滨,150040
文献出处：
引用格式：
[1]邢海彦;唐杰松;于耸;郑志民-.蓖麻miR396基因家族及其靶基因GRF生物信息学分析及鉴定)[J].中国油料作物学报,2022(02):344-353
A类：
MiR396,RcGRFs,619aa,RcmiR396,RcGRF
B类：
蓖麻,基因家族,靶基因,生物信息学分析,非生物胁迫,BLASTP,Pfam,等电点,分子量,Da,保守结构域,基序,QLQ,WRC,系统进化分析,双子叶,大豆,木薯,毛果杨,靶位,外显子,UTR,有组织,组织表达,达特,麻生,表达分析
AB值：
0.267077
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