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典型文献
茶树CsTIFY家族全基因组鉴定及非生物胁迫和激素处理中主要基因表达分析
文献摘要:
TIFY转录因子是陆地植物特有的转录因子,按照结构域特征共分为4个亚家族TIFY、PPD、JAZ、ZML,调控植物的生长发育过程.以茶树TIFY转录因子为研究对象,从茶树基因组数据库中共鉴定了22个CsTIFY转录因子家族成员,都包含了TIFY结构域.基因结构分析发现,大部分CsTIFY家族成员外显子数在5到12之间,同一亚家族所含Motif和外显子数相似.系统进化树表明,6个物种122个TIFY家族基因分为4个组,其中茶树与葡萄和杨树亲缘关系更近.启动子顺式作用元件分析发现CsTIFY家族含有大量响应SA、ABA、低温和干旱等的元件.亚细胞定位试验结果表明CsTIFY1、CsJAZ1和CsJAZ5定位于细胞核.不同茶树品种的组织表达量分析发现,大部分Cs TIFY在成熟叶、根和果实中相对表达量较高.在外源ABA、SA和MeJA处理下,大部分CsJAZ上调表达,而CsZML的表达量下降;低温和干旱处理下,CsZML1表达量都极显著上升.
文献关键词:
茶树;TIFY转录因子;全基因组鉴定;ABA;SA;MeJA;非生物胁迫;亚细胞定位
作者姓名:
谢思艺;周承哲;朱晨;詹冬梅;陈兰;吴祖春;赖钟雄;郭玉琼
作者机构:
福建农林大学园艺学院,茶产业研究院,福州350002;福建农林大学茶学福建省高校重点实验室,福州350002;福建农林大学园艺植物生物工程研究所,福州350002
文献出处:
引用格式:
[1]谢思艺;周承哲;朱晨;詹冬梅;陈兰;吴祖春;赖钟雄;郭玉琼-.茶树CsTIFY家族全基因组鉴定及非生物胁迫和激素处理中主要基因表达分析)[J].园艺学报,2022(01):100-116
A类:
CsTIFY,CsTIFY1,CsJAZ1,CsJAZ5,CsJAZ,CsZML,CsZML1
B类:
全基因组鉴定,非生物胁迫,激素处理,基因表达分析,陆地植物,结构域,亚家族,PPD,基因组数据,基因结构,员外,外显子,所含,Motif,系统进化树,家族基因,杨树,亲缘关系,启动子,顺式作用元件,SA,ABA,亚细胞定位,定位试验,细胞核,茶树品种,组织表达,表达量分析,成熟叶,相对表达量,MeJA,旱处理
AB值:
0.241336
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