典型文献
龙眼GDSL酯酶/脂肪酶基因的全基因组鉴定及表达分析
文献摘要：
基于第三代龙眼基因组数据库及其转录组数据库,通过生物信息学分析对龙眼GDSL酯酶/脂肪酶家族进行全基因组鉴定.结果显示龙眼GDSL(DlGDSL)家族共有118个成员,分为15个亚家族,亚细胞定位显示主要分布于细胞外基质中.染色体位置及共线性基因分析表明,118个DlGDSL基因中有111个定位在15条龙眼染色体上,包括13对共线性基因.基因结构和蛋白质保守基序分析表明该家族的外显子在2～12之间,且motif2和motif3是D1GDSL家族中尤为重要的保守基序.启动子顺式作用元件分析表明,启动子序列中包含众多光响应、激素应答、无氧诱导、胁迫响应和昼夜节律等响应元件,且大部分成员都含有茉莉酸甲酯(MeJA)、脱落酸(ABA)、生长素(IAA)和赤霉素(GA)等激素应答作用元件.FPKM值分析发现从胚性愈伤组织到球形胚阶段有26个差异表达的基因,提示DlGDSL家族部分成员可能在龙眼体胚形态建成中发挥重要作用.qRT-PCR分析表明,在外源ABA和MeJA处理下龙眼胚性愈伤组织中,DlGDSL家族部分成员可能与ABA、MeJA等激素信号转导相关.
文献关键词：
龙眼;GDSL;全基因组;鉴定;表达分析
中图分类号：
作者姓名：
刘梦雨;蒋梦琦;陈燕;张舒婷;薛晓东;肖学宸;赖钟雄;林玉玲
作者机构：
福建农林大学园艺植物生物工程研究所,福州350002
文献出处：
引用格式：
[1]刘梦雨;蒋梦琦;陈燕;张舒婷;薛晓东;肖学宸;赖钟雄;林玉玲-.龙眼GDSL酯酶/脂肪酶基因的全基因组鉴定及表达分析)[J].园艺学报,2022(03):597-612
A类：
DlGDSL,D1GDSL
B类：
龙眼,酯酶,脂肪酶,酶基因,全基因组鉴定,表达分析,第三代,基因组数据,转录组数据,生物信息学分析,亚家族,亚细胞定位,细胞外基质,共线性,基因分析,基因结构,质保,保守基序,外显子,motif2,motif3,顺式作用元件,启动子序列,光响应,激素应答,无氧,氧诱导,胁迫响应,昼夜节律,响应元,茉莉酸甲酯,MeJA,脱落酸,ABA,生长素,IAA,赤霉素,GA,FPKM,胚性愈伤组织,差异表达,形态建成,qRT,激素信号,信号转导
AB值：
0.31426
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