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四川省2012—2021年输入性登革病毒E基因分子特征分析
文献摘要：
目的:通过对2012—2021年四川省输入性登革病毒(dengue virus, DENV)E基因序列的分析，掌握四川省输入性DENV的血清型、基因型等分子特征，为溯源提供依据。方法:对2012—2021年四川省经Real time RT-qPCR检测DENV阳性的28份血清标本采用RT-PCR方法进行DENV E基因扩增及测序。利用Mega Align5.0软件对核苷酸序列和推导氨基酸序列进行比对分析，利用Mega 7.0软件绘制系统发育树。结果:经RT-PCR和序列测定获得了28株DENV的E基因序列，系统进化和同源性分析表明，20株属于DENV血清型1型(DENV-1)，其中16株为基因I型(Genotype-I, G-I)，4株为基因V型(Genotype-V, G-V)；7株属于DENV血清型2型(DENV-2)，其中4株为G-I，3株为基因II型(Genotype-II, G-II)；1株属于DENV血清型3型(DENV-3)，为G-I。四川株与东南亚国家以及我国广东等地的DENV病毒株同源性最高，与病例的流行病学调查资料完全吻合。结论:从分子水平证明了2012—2021年四川省输入性DENV存在3种血清型及其多种基因型，输入病例主要来源于东南亚国家。
文献关键词：
登革病毒;E基因;血清型;基因型;系统进化分析
中图分类号：
作者姓名：
李伟;蒋明凤;钟红荣;曹一鸥;冯玉亮
作者机构：
四川省疾病预防控制中心，成都 610041
文献出处：
引用格式：
[1]李伟;蒋明凤;钟红荣;曹一鸥;冯玉亮-.四川省2012—2021年输入性登革病毒E基因分子特征分析)[J].中华实验和临床病毒学杂志,2022(05):586-590
A类：
Align5
B类：
输入性,登革病毒,分子特征,dengue,virus,DENV,基因序列,血清型,基因型,Real,qPCR,血清标本,基因扩增,Mega,氨基酸序列,比对分析,绘制系统,系统发育树,序列测定,同源性分析,Genotype,II,东南亚国家,毒株,流行病学调查,调查资料,分子水平,输入病例,系统进化分析
AB值：
0.257304
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