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血清10型禽腺病毒AHFY19株全基因组序列测定与分析
文献摘要：
禽腺病毒(Fowl Adenovirus,FAdV)是一组血清型众多及致病性多样的病原体,多数呈亚临诊性长期潜伏带毒,部分毒株可造成禽群包涵体肝炎、心包积液、肌胃糜烂症、产蛋下降、生长迟缓等病症,严重威胁养禽业健康发展.为分析血清10型禽腺病毒(FAdV-10)全基因组序列特征,本研究将分离自外表健康鸡泄殖腔拭子的FAdV-10 AHFY19株经卵黄囊途径接种8日龄SPF鸡胚扩繁,从死亡鸡胚肝组织中提取病毒基因组,采用illumina二代基因测序技术和特殊结构区二温式PCR扩增测定病毒全基因组并分析其遗传特征.结果显示,AHFY19株(103.1EID50/0.1mL/枚)接种的鸡胚于18～21日龄全部死亡.全基因组测序显示,AHFY19株病毒基因组全长为45 757 bp(GenBank登录号:MN542422),其G+C含量为54.63％,末端重复序列(ITR)长为56 bp,共有52个开放阅读框(ORF).基因组比对分析显示,AHFY19株属Ⅰ群FAdV C种FAdV-10型,与C2-B-FAdV-10株(MK572851)全基因组同源性最高(99.91％),但 AHFY19株基因组多203 bp,差异位于fiber-1、fiber-2和ORF19A基因,然而这些差异并不存在于FAdV-10型C-2B株.AHFY19株与FAdV-4毒株全基因组核苷酸序列同源性在98.35％～98.58％之间.主要结构蛋白基因遗传进化分析显示,仅hexon基因发育进化树可区分C种FAdV-10型与FAdV-4型毒株.氨基酸分析显示,AHFY19株Hexon蛋白V188、Fiber-2蛋白G219和A380与FAdV-4型弱毒株一致.本研究为国内首次测定公布FAdV-10型病毒全基因组序列,其基因组分子特征为深入分析FAdV遗传演化提供了研究资料.
文献关键词：
血清10型禽腺病毒;全基因组;遗传分析
中图分类号：
作者姓名：
赵磊;张留君;刘欣超;刘畅;张训海
作者机构：
安徽科技学院 家禽疫病防控监测安徽省重点实验室,凤阳233100
文献出处：
引用格式：
[1]赵磊;张留君;刘欣超;刘畅;张训海-.血清10型禽腺病毒AHFY19株全基因组序列测定与分析)[J].病毒学报,2022(06):1411-1418
A类：
AHFY19,1EID50,MN542422,MK572851,ORF19A,V188
B类：
禽腺病毒,全基因组序列,序列测定,Fowl,Adenovirus,FAdV,血清型,致病性,病原体,带毒,毒株,包涵体肝炎,心包积液,糜烂,产蛋,生长迟缓,病症,养禽业,序列特征,自外,外表,泄殖腔,卵黄囊,日龄,SPF,鸡胚,扩繁,肝组织,病毒基因组,illumina,二代基因测序技术,特殊结构,遗传特征,1mL,全基因组测序,基因组全长,bp,GenBank,登录号,G+C,重复序列,ITR,开放阅读框,比对分析,C2,异位,fiber,2B,序列同源性,主要结构,结构蛋白,基因遗传,遗传进化分析,hexon,进化树,氨基酸分析,Hexon,Fiber,G219,A380,分子特征,遗传演化,研究资料,遗传分析
AB值：
0.343118
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