典型文献
云南省墨江县库蠓中一株西藏环状病毒的分离及全基因组序列分析
文献摘要:
西藏环状病毒(Tibet orbivirus,TIBOV)于2009年首次从中国西藏自治区采集的圆斑按蚊中分离出,目前在中国的云南省、广东省、湖南省和临国日本均有分离报道.2017年我们从云南省墨江县采集的库蠓样品中分离到一株病毒(MJC1-7),接种BHK-21和C6/36细胞后均可产生聚集、皱缩和脱落等明显细胞病变.1%的琼脂糖凝胶电泳显示,病毒基因组为十节段的双链RNA,呈现"3-3-3-1"的带型.通过病毒全长cDNA扩增和测序获取MJC1-7毒株的全基因组核苷酸序列,病毒基因组全长为19260 bp(包括编码区18495 bp和非编码区735 bp),由Seg-1(3 950 bp)至Seg-10(832 bp)的10个基因节段构成,可编码6 165个氨基酸残基.对环状病毒保守的VP1(Pol)、VP3(T2)和VP7(T13)蛋白氨基酸序列及系统发育分析显示,MJC1-7毒株与TIBOV亲缘关系最近,氨基酸序列相似度为95.4%~99.7%.对决定环状病毒血清型VP2(OC1)蛋白氨基酸序列与系统发育分析显示,MJC1-7与云南(SX-2017a、DH13C120和YN15-283-01)和广东(D181/2008)分离的TIBOV毒株聚为一簇,氨基酸序列相似度为97.3%~98.6%,而中国西藏毒株(XZ0906)和日本毒株(KSB-8/C/09和KSB-3/C/10)形成了另外3个独立的进化分支,MJC1-7与其相似度仅为27.8%~41.8%,以上结果表明MJC1-7毒株与云南和广东毒株有更近的亲缘关系,而中国西藏和日本毒株可能为Seg-2(OC1)基因变异较大毒株.本研究报道了一株TIBOV在我国云南省墨江县库蠓上的分离以及全基因组序列分析,研究结果进一步丰富了我们对TIBOV的认知,为深入研究我国TIBOV的分布、致病性与病原学检测技术提供了基础数据.
文献关键词:
库蠓;病毒分离;西藏环状病毒;序列分析
中图分类号:
作者姓名:
杨振兴;孟锦昕;何于雯;李楠;王静林
作者机构:
云南省畜牧兽医科学院云南省热带亚热带动物病毒病重点实验室,昆明650224
文献出处:
引用格式:
[1]杨振兴;孟锦昕;何于雯;李楠;王静林-.云南省墨江县库蠓中一株西藏环状病毒的分离及全基因组序列分析)[J].病毒学报,2022(06):1419-1428
A类:
orbivirus,TIBOV,MJC1,DH13C120,YN15,D181,XZ0906
B类:
云南省墨江县,库蠓,一株,西藏环状病毒,全基因组序列分析,Tibet,中国西藏自治区,按蚊,BHK,C6,皱缩,细胞病变,琼脂糖凝胶电泳,电泳显示,病毒基因组,十节,节段,双链,带型,cDNA,毒株,基因组全长,bp,非编码区,Seg,可编,氨基酸残基,VP1,Pol,VP3,VP7,T13,氨基酸序列,系统发育分析,亲缘关系,对决,毒血,血清型,VP2,OC1,SX,2017a,一簇,KSB,进化分支,南和,基因变异,致病性,病原学检测,病毒分离
AB值:
0.264694
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