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典型文献
2019-2020年湖北部分地区G9P[8]型人轮状病毒基因特征
文献摘要:
目的 对人A组轮状病毒进行检测及分离鉴定,并研究其各基因片段的遗传进化关系.方法 2019-2020年对湖北武汉市和襄阳市临床腹泻病人的粪便样品进行采集,共319份.设计特异性轮状病毒VP6基因引物,RT-PCR检测轮状病毒的感染情况.将阳性样品接种于MA104细胞进行轮状病毒的分离.RT-PCR特异性扩增VP6基因和特异性间接免疫荧光对其进行病毒鉴定及病毒增殖检测;并进一步通过RT-PCR扩增轮状病毒的11个基因片段,在线工具Rota C V2.0对测序结果进行分型分析.Mega软件对其全基因组序列进行遗传进化分析.结果 轮状病毒感染阳性标本共69份,阳性率为21.63%.成功分离获得11株人轮状病毒,主要衣壳蛋白VP7和VP4基因型均为G9P[8]型.其中3株轮状病毒归属于类Wa株毒株,基因型图谱为G9-P[8]-I1-R1-C1-M1-A1-N1-T1-E1-H1.8株毒株在Wa-like的基因型中具有DS-1-like的NSP4为E2基因型特征.基因型图谱为G9-P[8]-I1-R1-C1-M1-A1-N1-T1-E2-H1.结论 G9P[8]型人轮状病毒毒株在2019-2020年湖北部分地区占主导趋势,且其NSP4基因以E2基因型为主要流行形式.
文献关键词:
轮状病毒;分离鉴定;基因型;遗传进化分析
作者姓名:
杨立君;陈月;米文琴;唐一通;范久波;王媛;廖诗英;陈焕春;何启盖;江云波
作者机构:
华中农业大学动物医学院农业微生物学国家重点实验室,武汉 430070;湖北文理学院医学部,武汉 430070
引用格式:
[1]杨立君;陈月;米文琴;唐一通;范久波;王媛;廖诗英;陈焕春;何启盖;江云波-.2019-2020年湖北部分地区G9P[8]型人轮状病毒基因特征)[J].中国人兽共患病学报,2022(04):359-365
A类:
MA104
B类:
G9P,病毒基因,基因特征,分离鉴定,进化关系,湖北武汉,武汉市,襄阳市,腹泻病人,粪便样品,VP6,引物,感染情况,间接免疫荧光,病毒鉴定,病毒增殖,Rota,V2,Mega,全基因组序列,遗传进化分析,轮状病毒感染,阳性标本,功分,衣壳蛋白,VP7,VP4,基因型,归属于,Wa,I1,R1,C1,M1,N1,E1,H1,like,DS,NSP4,E2,病毒毒株
AB值:
0.322093
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