典型文献
2016年乌鲁木齐市5株高致病性H5N8禽流感病毒的分离鉴定和遗传进化分析
文献摘要:
目的:对新疆乌鲁木齐市活禽市场家禽中分离的H5N8亚型禽流感病毒(avian influenza virus, AIV)进行遗传进化和分子特征分析。方法:2016年于乌鲁木齐市某活禽市场采集家禽咽和泄殖腔拭子,经接种鸡胚、血凝试验和RT-PCR等方法分离鉴定AIV,以AIV通用引物扩增病毒基因并进行全基因组测序,利用BLAST、Clustal W、MEGA-X和DNAStar等软件进行序列比对、系统进化和分子特征分析。结果:从家禽双腔拭子样品分离到5株H5N8 AIVs,其各基因的一致性在99.70%~100.00%之间,说明5株病毒为同一来源,统一命名为XJ-H5N8/2016。系统进化分析表明,该病毒株血凝素基因(
HA)、
PB2和
NS均与2016—2017年湖北、山西和三门峡等地迁徙天鹅以及印度水鸭中分离的H5N8 AIVs聚在一起,同时,3个基因还与国内水貂中分离的H5N6 AIVs以及福建首例人感染H5N6 AIVs聚在一起;神经氨酸酶基因(
NA)与2016年印度水鸭中分离的H5N8 AIVs聚在同一终末分支;
PB1、
MP、
PA和
NP均与2017年自埃及、喀麦隆、乌干达、刚果等非洲国家野鸟和家禽中分离的H5N8 AIVs聚在一起。XJ-H5N8/2016的HA裂解位点均含5个连续的碱性氨基酸,为高致病性,病毒基因发生的多个突变可增强病毒对哺乳动物的毒力和致病力。
结论:从活禽市场分离的5株H5N8 AIVs呈高致病性,与2016—2017年湖北、山西、三门峡等地区以及非洲和印度等地迁徙候鸟和家禽中分离的H5N8 AIVs进化关系密切,部分基因还与国内水貂中分离以及感染人的H5N6 AIVs的遗传关系较近,其多个突变可增强AIV对哺乳动物的感染力和致病力,潜在感染人类和威胁公共卫生安全的风险。
文献关键词:
禽流感病毒;H5N8;活禽市场;候鸟;遗传进化
中图分类号:
作者姓名:
张丽娟;张成;杜瀚;贠丰泽;杜菲;常昱昊;毕玉海;马正海
作者机构:
新疆大学生命科学与技术学院,新疆生物资源基因工程重点实验室,乌鲁木齐 830046;中国科学院微生物研究所,病原微生物与免疫学重点实验室,流感研究与预警中心,北京 100101
文献出处:
引用格式:
[1]张丽娟;张成;杜瀚;贠丰泽;杜菲;常昱昊;毕玉海;马正海-.2016年乌鲁木齐市5株高致病性H5N8禽流感病毒的分离鉴定和遗传进化分析)[J].中华微生物学和免疫学杂志,2022(08):615-622
A类:
B类:
乌鲁木齐市,株高,高致病性,H5N8,禽流感病毒,分离鉴定,遗传进化分析,活禽市场,家禽,avian,influenza,virus,分子特征,泄殖腔,种鸡,鸡胚,通用引物,病毒基因,全基因组测序,BLAST,Clustal,MEGA,DNAStar,序列比对,双腔,子样,AIVs,一来,统一命名,XJ,系统进化分析,毒株,血凝素,HA,PB2,NS,西和,三门峡,天鹅,水鸭,聚在一起,水貂,H5N6,首例,神经氨酸酶,酶基因,终末,PB1,MP,PA,NP,埃及,喀麦隆,乌干达,刚果,非洲国家,野鸟,碱性氨基酸,哺乳动物,毒力,致病力,迁徙候鸟,进化关系,遗传关系,感染力,公共卫生安全
AB值:
0.316317
机标中图分类号,由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成,仅供学习研究参考。