FAILED
首站-论文投稿智能助手
典型文献
一个遗传性痉挛性截瘫4型家系SPAST基因的新变异分析
文献摘要:
目的:对一个来自山西省长治市的遗传性痉挛性截瘫(hereditary spastic paraplegia,HSP)家系的SPAST基因新变异进行分析,进一步研究该变异基因型与临床表型的关系,明确该家系患者的致病性原因。方法:2019年10月在长治医学院附属和平医院神经内科门诊收集一个HSP家系,抽取先证者及其他8名成员的外周静脉血各2 ml,提取血标本中的基因组DNA,应用二代测序技术(next generation sequencing,NGS)对先证者的痉挛性截瘫相关疾病的基因进行初步筛选,利用HGMD、1000G、OMIM等数据库及PolyPhen2、SIFT等软件对可疑变异进行生物信息学分析。然后利用多重连接依赖性探针扩增(multiplex ligation-dependent probe amplification,MLPA)技术进一步筛选NGS检测后仍为阴性的患者的总缺失/重复变异,并对可疑致病性变异位点进行家系内Sanger测序验证以便明确变异位点在该家系内的共分离情况。最后,参考最新版美国医学遗传学与基因组学学会(ACMG)的序列变异解读指南,对变异位点进行详细分析以明确致病性。结果:该HSP家系共4代47名成员,有10例患者,发病年龄在2~44岁之间。先证者的女儿仅查体可见双侧巴宾斯基征阳性,余患者在此基础上均表现为轻重不一的双下肢痉挛、无力。通过NGS检测技术筛出了2个可疑变异,即SPAST基因c.1057_1058insCC(p.Leu354HisfsTer11)移码变异和DCTN1 基因c.2213A>G(p.Gln738Arg)错义变异。利用Sanger测序对家系进行验证,结果提示该家系受影响的患病成员(先证者的父亲、弟弟、儿子、女儿)均检测到SPAST基因c.1057_1058insCC(p.Leu354HisfsTer11)移码变异,未受影响的正常成员(先证者的妻子、母亲、妹妹、弟媳)均未检测到该变异。而该家系未受影响的正常成员先证者的母亲检测到DCTN1 基因c.2213A>G(p.Gln738Arg)错义变异,余7名成员均未检测到该变异。另外,MLPA结果提示未发现受检者基因存在大片段变异。结论:该HSP家系临床特征和基因结果均高度符合单纯型遗传性痉挛性截瘫4型(SPG4),遗传模式呈常染色体显性遗传。SPAST基因c.1057_1058insCC(p.Leu354HisfsTer11)移码变异在该SPG4家系成员中存在共分离,是该HSP-SPG4家系患者的致病性原因,且为新发现的变异位点。
文献关键词:
痉挛性截瘫,遗传性;突变;序列分析,DNA
作者姓名:
张利平;王玉芬
作者机构:
长治医学院附属和平医院神经内科,长治 046000
文献出处:
引用格式:
[1]张利平;王玉芬-.一个遗传性痉挛性截瘫4型家系SPAST基因的新变异分析)[J].中华内科杂志,2022(12):1343-1350
A类:
1058insCC,Leu354HisfsTer11,2213A,Gln738Arg
B类:
遗传性痉挛性截瘫,家系,SPAST,新变异,变异分析,省长,长治市,hereditary,spastic,paraplegia,HSP,异基因,基因型,临床表型,长治医学院,和平医院,神经内科,内科门诊,先证者,外周静脉血,ml,血标本,二代测序技术,next,generation,sequencing,NGS,相关疾病,初步筛选,HGMD,1000G,OMIM,PolyPhen2,SIFT,可疑,生物信息学分析,multiplex,ligation,dependent,probe,amplification,MLPA,复变,致病性变异,变异位点,行家,Sanger,离情,最新版,医学遗传学,基因组学,ACMG,序列变异,发病年龄,女儿,查体,双下肢,下肢痉挛,无力,移码变异,DCTN1,错义变异,病成,父亲,弟弟,儿子,常成,妻子,妹妹,弟媳,未检,受检者,大片,单纯型,SPG4,遗传模式,常染色体显性遗传,异在,新发现,序列分析
AB值:
0.32534
相似文献
机标中图分类号,由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成,仅供学习研究参考。