典型文献
潘那利番茄GRF基因家族全基因组鉴定分析
文献摘要:
[目的]分析研究潘那利番茄GRF基因家族全基因组鉴定分析.[方法]研究基于生物信息学方法对潘那利GRF基因家族成员进行全基因组鉴定和分析,并对其起源及进化进行了追溯.[结果]潘那利番茄中共鉴定了 10个SpGRF成员,不均匀分布在7条染色体上,预测了 SpGRFs蛋白的分子量、等电点、亲水性总均值等理化性质.SpGRFs基因可分为6个亚家族.所有SpGRF基因N端都含有1个QLQ和1个WRC结构域,C端则为多种保守基序.共线性结果显示基因组内有3对6个旁系同源基因,全部为片段复制,SpGRFs受自然选择压力下,有共同起源祖先,与拟南芥亲缘关系更近.[结论]鉴定了潘那利番茄中GRF基因家族的基本信息.
文献关键词:
潘那利番茄;GRF基因家族;全基因组分析;生物信息学
中图分类号:
作者姓名:
戴麒;徐瑞强;李宁;王柏柯;王娟;黄少勇;帕提古丽·艾斯木托拉;余庆辉
作者机构:
新疆农业科学院园艺作物研究所,乌鲁木齐 830091;新疆农业大学林学与园艺学院,乌鲁木齐 830042
文献出处:
引用格式:
[1]戴麒;徐瑞强;李宁;王柏柯;王娟;黄少勇;帕提古丽·艾斯木托拉;余庆辉-.潘那利番茄GRF基因家族全基因组鉴定分析)[J].新疆农业科学,2022(10):2456-2465
A类:
潘那利番茄,SpGRF,SpGRFs
B类:
基因家族,全基因组鉴定,鉴定分析,生物信息学方法,不均匀分布,分子量,等电点,亲水性,亚家族,QLQ,WRC,结构域,保守基序,共线性,旁系,同源基因,自然选择,选择压力,共同起源,祖先,拟南芥,亲缘关系,全基因组分析
AB值:
0.254477
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