典型文献
绵羊KIAA2012与UTP20多态、胴体品质性状关联与生物信息学分析
文献摘要:
为探究KIAA2012和UTP20多态性与胸椎数间的关联性,筛选胸椎数相关重要分子标记,利用Sequenom MassARRAY?SNP技术检测苏尼特羊和小尾寒羊中与胸椎数相关候选基因KIAA2012和UTP20的单核苷酸多态性(SNPs)位点,开展群体遗传学分析,并与胸椎数进行关联分析;利用生物信息学分析工具对KIAA2012和UTP20的遗传特征进行分析.结果表明,UTP20g.170058254G>A位点在苏尼特羊群体中突变型(GA)胸椎数显著(P<0.05)高于野生型(GG),g.170053888G>A和g.170072471G>A在小尾寒羊和苏尼特羊中均与胸椎数没有显著相关;KI-AA2012 g.203440537A>G、g.203424302A>G、g.203440384A>T在小尾寒羊和苏尼特羊中与胸椎数均没有显著相关(P>0.05).SNPs与胴体长度分析结果表明,在小尾寒羊KIAA2012g.203440537A>G中,突变型(GA)胴体长度显著(P<0.05)高于野生型(GG).生物信息学分析表明,KIAA2012为亲水蛋白,UTP20为疏水蛋白,两者蛋白结构均不稳定,无跨膜结构域.综上所述,UTP20 g.170058254G>A位点与苏尼特羊胸椎数性状显著相关,KIAA2012 g.203440537A>G与小尾寒羊胴体长度性状显著相关,可作为调控绵羊胸椎数变异潜在的分子辅助标记.
文献关键词:
KIAA2012;UTP20;SNPs;胸椎数;绵羊
中图分类号:
作者姓名:
郭思武;储明星;刘玉芳
作者机构:
河北工程大学生命科学与食品工程学院,河北邯郸 056001;中国农业科学院北京畜牧兽医研究所/农业农村部动物遗传育种与繁殖重点实验室,北京 100193
文献出处:
引用格式:
[1]郭思武;储明星;刘玉芳-.绵羊KIAA2012与UTP20多态、胴体品质性状关联与生物信息学分析)[J].畜牧与兽医,2022(03):1-10
A类:
KIAA2012,UTP20,UTP20g,170058254G,170053888G,170072471G,AA2012,203440537A,203424302A,203440384A,KIAA2012g
B类:
绵羊,胴体品质,品质性状,性状关联,生物信息学分析,胸椎数,数间,分子标记,Sequenom,MassARRAY,苏尼特羊,小尾寒羊,候选基因,单核苷酸多态性,SNPs,群体遗传学,遗传学分析,利用生物,遗传特征,羊群,突变型,GA,野生型,GG,胴体长,亲水,疏水蛋白,蛋白结构,跨膜结构域,综上所述,羊胴体
AB值:
0.178679
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