典型文献
重组G3P[13]型A群猪轮状病毒全基因组测序分析
文献摘要：
为了解引发四川某猪场腹泻疫情的猪轮状病毒(PoRV)基因组特征和遗传变异规律,采用RT-PCR分别扩增PoRV 11个基因节段,并克隆测序,通过生物信息学分析软件研究病毒基因组特征、变异性及遗传进化规律.结果显示,SCMY-1株基因合型为G3-P[13]-I5-R1-C1-M1-A8-N1-T1-E1-H1,即G3P[13]型毒株.该毒株VP2、NSP2和NSP4基因与人源毒株同源性最高,分别与3株人源轮状病毒RVA/Human-wt/LKA/R1207/2009株、RVA/Human-wt/ZAF/UFS-NGS-MRC-DPRU2291/2009和RVA/Human/CU331-NR/08株单独聚为一小支,推测这可能增加SCMY-1株跨种传播到人的风险.此外,SCMY-1株VP4基因与美国3个猪源毒株同处一个小分支;VP7基因与RVA/Pig/China/LNCY/2016株遗传进化距离最近.上述结果提示,PoRV可能在国际和国内生猪贸易过程中被广泛传播.与NCBI上已登录毒株相比,SCMY-1株VP4、VP7蛋白氨基酸分别存在13个和2个独有氨基酸位点的突变,可能对VP4和VP7两个主要抗原毒力及抗原性产生影响.重组分析显示,SCMY-1株VP3基因由两个猪源亲本株重组而来,推测这可能增强病毒毒力和宿主适应性.研究结果丰富了PoRV基因组学和分子流行病学相关研究资料,为PoRV预防控制提供理论参考,也为深入研究PoRV跨物种传播的分子基础提供科学依据.
文献关键词：
G3P[13]型A群猪轮状病毒;基因组;遗传变异;基因重组
中图分类号：
作者姓名：
王一丹;向华;张斌;向萌;任玉鹏;邱文英;付利芝
作者机构：
西南民族大学畜牧兽医学院,四川成都 610041;华派生物工程集团有限公司,四川成都 610000;重庆畜牧科学院,重庆 402460
文献出处：
引用格式：
[1]王一丹;向华;张斌;向萌;任玉鹏;邱文英;付利芝-.重组G3P[13]型A群猪轮状病毒全基因组测序分析)[J].动物医学进展,2022(04):1-7
A类：
SCMY,R1207,ZAF,DPRU2291,CU331,LNCY
B类：
G3P,猪轮状病毒,全基因组测序分析,猪场,PoRV,基因组特征,遗传变异,变异规律,节段,克隆测序,生物信息学分析,软件研究,病毒基因组,变异性,遗传进化,进化规律,I5,C1,M1,A8,N1,E1,H1,毒株,VP2,NSP2,NSP4,同源性,RVA,Human,wt,LKA,UFS,NGS,MRC,NR,一小,小支,跨种传播,播到,VP4,猪源,VP7,Pig,China,进化距离,生猪,贸易过程,广泛传播,NCBI,登录,别存,氨基酸位点,毒力,抗原性,重组分析,VP3,因由,亲本株,株重,宿主适应性,基因组学,分子流行病学,研究资料,预防控制,跨物种,分子基础,基因重组
AB值：
0.410274
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