目的 通过DEAD-box解旋酶5(DDX5)构建信号调控网络,以探讨DDX5在头颈部鳞癌中的表达及临床意义.方法 通过芯片技术获得人类mRNA和circRNA的表达谱,筛选出差异表达circRNA和差异表达mRNA.利用Arraystar的microRNA靶点预测软件和OncomiR线上数据库预测circRNA作用miRNA的靶点.再利用Targetscan线数据库预测差异表达miRNA靶向结合的mRNA,与DEGs取交集获得潜在头颈鳞癌中的潜在靶基因.对差异表达mRNA进行功能富集分析,最后利用Cytoscape软件构建circRNA-miRNA-mRNA轴的调控网络.对筛选出的DDX5采用免疫组化、RT-qPCR验证.结果 在5对HNSCC及癌旁组织中检测到287个DEcircRNAs和1053个DEGs.通过进行交集筛选,构建一个由2个circRNA、4个miRNA和75个mRNA靶向调控的ceRNA网络,最终发现circRNA-102485-miRNA-103a-2-5p-DDX5轴.DDX5的表达与患者的临床分期(P<0.05)、性别(P<0.05)和肿瘤解剖细分(P<0.05)显著相关.与癌旁组织比较,DDX5在头颈鳞癌组织中主要聚集于细胞质,DDX5在头颈鳞癌组织的表达增加,P<0.05.结论 DDX5在头颈鳞癌中的表达相对上调,且在临床分期方面有统计学意义,故其可作为头颈部鳞癌中诊断和治疗的潜在靶点.

DDX5解旋酶;p68;RNA解旋酶;头颈部鳞癌;microRNA;circRNA;生物信息学

王文龙;刘郭琦;宋娇娇;于栋林;唐娟;薛博元;黄玉梅

滨州医学院附属医院口腔颌面外科 山东 滨州 256603;滨州医学院附属医院口腔修复科 山东 滨州 256603

滨州医学院学报

[1]王文龙;刘郭琦;宋娇娇;于栋林;唐娟;薛博元;黄玉梅-.基于生物信息学分析DDX5在头颈部鳞癌中的表达及意义)[J].滨州医学院学报,2022(04):248-256

DEcircRNAs,p68

生物信息学分析,DDX5,头颈部鳞癌,DEAD,box,解旋酶,信号调控网络,芯片技术,技术获得,表达谱,出差,差异表达,Arraystar,microRNA,靶点预测,预测软件,OncomiR,上数,miRNA,Targetscan,DEGs,交集,头颈鳞癌,靶基因,功能富集分析,Cytoscape,软件构建,免疫组化,qPCR,HNSCC,癌旁组织,靶向调控,ceRNA,103a,5p,临床分期,癌组织,细胞质,诊断和治疗,潜在靶点

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