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氯化锂-匹罗卡品诱导癫痫大鼠海马组织差异表达circRNA的筛选及功能分析
文献摘要：
目的:探究氯化锂-匹罗卡品诱导癫痫大鼠海马组织差异表达共价闭合、单链环状RNA(circRNA)及功能分析.方法:通过构建氯化锂-匹罗卡品癫痫大鼠模型,取癫痫大鼠及对照大鼠海马组织通过Illumina高通量测序平台进行转录组测序,并通过EdgeR包对circRNA进行差异分析、通过R语言进行GO及KEGG信号通路富集分析,通过Targetscan与miRanda软件进行circRNA与miRNA互作分析寻找circRNA核心调控靶标.结果:对照组及癫痫组大鼠海马的circRNA进行差异分析获得的262个差异表达circRNA,信号通路富集分析发现与胞蛋白修饰过程、蛋白质变性过程、树突形态调控、神经元分化调节、离子跨膜转运的调节等生物过程相关.并进一步确定了可能与circRNA存在互作的核心调控miRNA,包括miR-322-5p、miR-322-3p、miR-323-5p、miR-323-3p、miR-301a-5p、miR-301a-3p、miR-324-5p、miR-324-3p等.结论:本研究筛选了氯化锂-匹罗卡品点燃癫痫大鼠与正常大鼠脑组织差异circRNA,系统地分析了其可能的作用功能机制,为癫痫诊断或治疗寻找到可靠的生物标志物.
文献关键词：
氯化锂-匹罗卡品;癫痫;circRNA;miRNA
中图分类号：
作者姓名：
黄亚辉;杨萍;朱勇;王琴;卢军;贺冰;张熙
作者机构：
湖南省脑科医院(湖南中医药大学临床医学院)癫痫中心 长沙 410007;湖南中医药大学附属第二医院中医科 长沙 410007
文献出处：
引用格式：
[1]黄亚辉;杨萍;朱勇;王琴;卢军;贺冰;张熙-.氯化锂-匹罗卡品诱导癫痫大鼠海马组织差异表达circRNA的筛选及功能分析)[J].神经损伤与功能重建,2022(06):315-319
A类：
B类：
氯化锂,匹罗卡品,海马组织,组织差异表达,circRNA,功能分析,共价闭,单链,链环,癫痫大鼠模型,Illumina,高通量测序平台,转录组测序,EdgeR,信号通路富集,通路富集分析,Targetscan,miRanda,miRNA,互作分析,靶标,蛋白修饰,饰过,蛋白质变性,树突,形态调控,神经元分化,跨膜转运,生物过程,5p,3p,301a,点燃,大鼠脑组织,作用功能,功能机制,生物标志物
AB值：
0.322742
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