典型文献
尼古丁影响糖尿病心肌病进展的机制研究
文献摘要:
目的 基于生物信息学技术深度挖掘人糖尿病心肌病相关数据库,揭示尼古丁对糖尿病心肌病(DCM)的作用靶点进而阐明其相关机制.方法 通过3大数据库(GEO数据库、Drug bank数据库、STRING数据库)和WGCNA分析对DCM和尼古丁的相关基因进行筛选,揭示尼古丁影响DCM的潜在的hub基因,基于hub基因本体(GO)分析和基因组百科全书(KEGG)分析,通过Cytoscape软件构建影响DCM的hub基因网络以及关键靶点相关通路的交互图,进一步对hub基因和疾病调控基因进行相关性分析,鉴定hub基因与免疫浸润的关系,最后构建hub基因参与的miRNA-mRNA共表达网络,预测hub基因的转录因子,同时ROC曲线探讨靶点与DCM发生发展的关系.结果 共筛选出630个差异基因,共2个hub基因:神经元乙酰胆碱受体β4亚基(Chrnb4)、细胞色素酶P4501A1(Cyp1a1),其主要参与Fe3+反应、维甲酸生物合成过程和影响色氨酸代谢、卵巢类固醇生成;尼古丁通过hub基因加重DCM心肌病进程主要与免疫细胞含量显著相关,此调节过程涉及35个miRNA,2个mRNA,Cyp1a1转录因子;ROC曲线显示Chrnb4(AUC:0.707)、Cypla1(AUC:0.769)可作为DCM心肌病的诊断指标.结论 尼古丁可加重DCM心肌病的进程,其与Chrnb4、Cyp1a1相关并通过miRNA-RNA互作调节免疫细胞含量,从而可为治疗吸烟人群中DCM患者心脏的损伤情况提供新的思路.
文献关键词:
生物信息学;糖尿病心肌病;尼古丁;分子机制
中图分类号:
作者姓名:
赵静;郭蕊;孟芝君;刘彩红;谢耀丽;刘晶;曹济民;王亚静
作者机构:
山西医科大学基础医学院,山西 太原 030001;山西医科大学附属人民医院/山西省人民医院检验科,山西 太原 030001;山西医科大学第二医院内分泌科,山西 太原 030001
文献出处:
引用格式:
[1]赵静;郭蕊;孟芝君;刘彩红;谢耀丽;刘晶;曹济民;王亚静-.尼古丁影响糖尿病心肌病进展的机制研究)[J].医学信息,2022(23):32-40,49
A类:
Chrnb4,Cyp1a1,Cypla1
B类:
尼古丁,糖尿病心肌病,生物信息学技术,深度挖掘,DCM,作用靶点,相关机制,大数据库,GEO,Drug,bank,STRING,WGCNA,hub,基因本体,百科全书,Cytoscape,软件构建,关键靶点,相关通路,调控基因,免疫浸润,miRNA,共表达网络,差异基因,乙酰胆碱受体,亚基,细胞色素酶,P4501A1,Fe3+,维甲酸,生物合成,合成过程,色氨酸代谢,类固醇,免疫细胞,诊断指标,调节免疫,吸烟人群,伤情
AB值:
0.261142
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