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典型文献
miRNA-mRNA双重表达谱在前列腺癌分子调控机制中的作用
文献摘要:
目的 对前列腺癌的mRNA和miRNA的双重表达谱进行生物信息学分析,探讨前列腺癌的分子调控机制并识别与前列腺癌相关的生物标记.方法 从GEO数据库中获取前列腺癌的mRNA和miRNA双重表达谱数据,首先采用差异表达分析提取与前列腺癌相关的上调和下调的miRNA和mRNA,然后通过Pearson相关分析确定最显著上调的和下调的miRNA与其靶向基因的反向调控关系,通过广义典型相关分析(GCCA)探讨miRNA和mRNA的分子调控机制并构建调控网络,识别与前列腺癌相关的生物标记.结果 共发现117个差异表达的miRNA和9054个差异表达的mRNA,其中有15个miRNA和35个mRNA表达下调,20个miRNA和36个mRNA表达上调;Pearson相关性分析显示,miR-137反向调控HOXC4、NPIPL3和 WSB1,miR-367反向调控MEFA及TNFAIP6;GCCA分析显示,MED13L的第一主成分权系数在前列腺癌患者中最高,第一主成分权系数较高的TRRAP被证实与前列腺癌高度;miR-29b、miR-488*与前列腺癌高度关联且在miRNA-mRNA的分子调控网络中调控的基因数最多.结论 miR-29b和miR-29b-1*在前列腺癌相关的分子调控机制中有着重要的作用,可以作为潜在的阻止前列腺癌发生和发展的治疗靶向.
文献关键词:
前列腺癌;miRNA;mRNA;分子调控机制
作者姓名:
胡嘉莉;华琳
作者机构:
首都医科大学生物医学工程学院,北京100069
文献出处:
引用格式:
[1]胡嘉莉;华琳-.miRNA-mRNA双重表达谱在前列腺癌分子调控机制中的作用)[J].医学信息,2022(16):18-23
A类:
GCCA,HOXC4,NPIPL3,WSB1,MEFA,MED13L,TRRAP
B类:
miRNA,表达谱,分子调控机制,生物信息学分析,生物标记,GEO,谱数据,差异表达分析,典型相关分析,TNFAIP6,分权,权系数,前列腺癌患者,29b,分子调控网络,数最多
AB值:
0.12716
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