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典型文献
基于生物信息学分析ADNP在原发性肝癌中的表达及预后
文献摘要:
目的 利用生物信息学方法分析ADNP的表达与原发性肝癌患者生存预后的关系,挖掘其对肝癌发生发展可能存在的潜在机制并探讨临床意义.方法 首先分析ADNP mRNA在泛癌中的表达差异,然后对ADNP在原发性肝癌中的表达进行配对差异分析和Meta分析,同时使用HPA数据库分析ADNP蛋白在癌旁和肝癌组织之间的表达差异;结合TCGA肝癌各项临床数据资料进行单因素与多因素分析肝癌预后的影响因素,根据生存时间和生存状态数据评估肝癌患者的生存率,初步分析ADNP在肝癌预后的价值;利用GSEA软件对ADNP基因进行KEGG和GO富集分析,通过高富集的通路和生物过程探究ADNP在肿瘤发生发展中可能的作用机制,此外,基于TIMER数据库分析免疫浸润细胞和ADNP表达之间的相关性,接着对TCGA肝癌ADNP表达与肿瘤微环境相关性分析,最后通过CellMiner数据库分析ADNP的表达对不同药物的相关性和敏感性,分析ADNP表达在原发性肝癌治疗中的功能.结果 ADNP mRNA在多种肿瘤中呈高表达;并且ADNP mRNA和蛋白在原发性肝癌组织和癌旁组织之间的表达具有差异性(P<0.05);生存分析结果表明ADNP低表达组的肝癌患者预后更佳(P<0.05);单因素和多因素分析均提示ADNP mRNA是原发性肝癌独立预后因子;ANDP mRNA的表达在不同性别,恶性度,分期和肿瘤大小的表达也具有不同程度的差异性(P<0.05);GSEA提示高表达ADNP在多种肿瘤和免疫通路以及细胞周期等生物过程均得到高富集;ADNP表达与6种免疫浸润细胞均为正相关;与ADNP具有较高敏感性和相关性的药物有白屈菜赤碱、寄端霉素、p-xylene316等.结论 ADNP在原发性肝癌中的表达高于癌旁组织,ADNP mRNA表达量是独立预后因子,ADNP可能是肝癌的显著生物标志物,检测ADNP的表达水平有助于原发性肝癌患者预后的评估分析.
文献关键词:
肝癌;ADNP;数据库;预后分析
作者姓名:
梁箫;詹雪冰;罗倩;况云舒;齐颖;刘慧芳;王俊杰;孙恩涛;陈冰
作者机构:
皖南医学院病理学教研室,安徽 芜湖 241002;皖南医学院检验学院,安徽 芜湖 241002
引用格式:
[1]梁箫;詹雪冰;罗倩;况云舒;齐颖;刘慧芳;王俊杰;孙恩涛;陈冰-.基于生物信息学分析ADNP在原发性肝癌中的表达及预后)[J].牡丹江医学院学报,2022(05):41-46
A类:
ANDP,xylene316
B类:
生物信息学分析,ADNP,原发性肝癌,利用生物,生物信息学方法,肝癌患者,生存预后,潜在机制,泛癌,表达差异,HPA,数据库分析,肝癌组织,TCGA,临床数据,数据资料,多因素分析,生存时间,生存状态,状态数据,数据评估,初步分析,GSEA,富集分析,生物过程,过程探究,肿瘤发生发展,TIMER,免疫浸润细胞,肿瘤微环境,环境相关性,CellMiner,不同药物,肝癌治疗,癌旁组织,生存分析,低表达,预后因子,肿瘤大小,细胞周期,白屈菜,生物标志物,评估分析,预后分析
AB值:
0.221546
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