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典型文献
基于ITS2的和田玫瑰分子进化分析
文献摘要:
目的:分析和田玫瑰分子系统发育进化式样并评价其道地性.方法:采用聚合酶链式反应获得和田玫瑰内转录间隔区2(ITS2)序列,在美国国家生物技术信息中心数据库(NCBI)比对,从GenBank获取邻近属ITS2序列共52条,利用MEGA X软件进行多重比对分析,构建邻接(NJ)系统发育树,推断进化时间,预测ITS2序列二级结构.结果:基于ITS2引物扩增获得长度为409 bp的序列,包括小亚基核糖体核糖核酸基因和内部转录间隔区的部分序列(1~39 bp)、5.8S核糖体核糖核酸基因全序列(40~64 bp)、ITS2标准全序列(65~268 bp)、大亚基核糖体核糖核酸基因的部分序列(269~409 bp).分析发现和田玫瑰与英国、意大利等欧洲产玫瑰Rosa sherardii距离最近,共同亲本是大马士革玫瑰,和田玫瑰于20000多年前开始出现.结论:和田玫瑰ITS2标准序列为204 bp,起源于欧洲大马士革玫瑰,分歧进化时间约为29000年,与《中华人民共和国药典》2020年版收录玫瑰花的ITS2序列二级结构的区别主要在Ⅲ螺旋区部位.
文献关键词:
和田玫瑰;道地性;内转录间隔区2;系统发育;进化时间
作者姓名:
宁慧霞;鹿娟娟;鲁春芳;文洪江;努尔波拉提·阿依达尔汗;海白尔·火加艾合买提;刘戈宇
作者机构:
中国科学院 新疆理化技术研究所 中国科学院干旱区植物资源化学重点实验室/省部共建新疆特有药用资源利用重点实验室,新疆 乌鲁木齐 830011;中国科学院 新疆分院,新疆 乌鲁木齐 830011;乌鲁木齐市技术创新研发与科技成果转化中心,新疆 乌鲁木齐 830002;中国科学院大学 化学科学学院,北京 100190
文献出处:
引用格式:
[1]宁慧霞;鹿娟娟;鲁春芳;文洪江;努尔波拉提·阿依达尔汗;海白尔·火加艾合买提;刘戈宇-.基于ITS2的和田玫瑰分子进化分析)[J].中国现代中药,2022(07):1225-1233
A类:
和田玫瑰,sherardii
B类:
ITS2,分子进化,进化分析,分子系统发育,式样,道地性,聚合酶链式反应,内转录间隔区,生物技术,信息中心,中心数据库,NCBI,GenBank,MEGA,比对分析,邻接,NJ,系统发育树,进化时间,二级结构,引物,bp,亚基,核糖体,核糖核酸,内部转录间隔区,8S,全序,意大利,Rosa,亲本,大马士革玫瑰,中华人民共和国药典,玫瑰花
AB值:
0.270756
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