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基于16S rRNA高通量测序分析9种中药饮片污染微生物群落特征
文献摘要：
目的:基于16S核糖体RNA(16S rRNA)高通量测序分析浙江省湖州市南太湖地区9种中药饮片的污染微生物群落特征.方法:根据《中华人民共和国药典》(2020年版)对柴胡、白术、山药、玄参、麦冬、焦栀子、砂仁、铁皮枫斗、金银花共9种中药饮片进行控制菌检查和分类鉴定,同时采用16S rRNA高通量测序法测定基因序列并将优化后的序列与数据库比对,进行多样性分析,分析微生物群落特征.结果:(1)90批中药饮片中有1批山药检测出沙门菌和大肠埃希菌,有41批(45.56％)检出耐胆盐革兰氏阴性菌.经菌落鉴定共获得4个科10个属共15种污染微生物,其中包括阴沟肠杆菌、铜绿假单胞菌、阪崎克罗诺杆菌、沙门氏菌、大肠埃希菌、肺炎克雷伯氏菌、鲍曼不动杆菌、奇异变形杆菌等致病菌或条件致病菌.(2)高通量测序共获得32个属、186种污染微生物,山药、白术、柴胡鉴定出的微生物种类最高,分别为112、95、88,焦栀子、铁皮枫斗和麦冬获得微生物种类最少,分别为20、26、34.经多样性分析,柴胡、白术和山药具有最高的Chaol指数,柴胡、山药和砂仁具有最高的Shannon指数,柴胡、山药和砂仁具有最高的Simpson指数.优势菌属为肠杆菌属、假单胞菌属、泛菌属、变形杆菌属、不动杆菌属、克罗诺杆菌属、克雷伯氏菌属、芽孢杆菌属、葡萄球菌属、链球菌属、肠球菌属.结论:上述中药饮片中存在微生物污染,有一定的致病风险.与传统平板培养相比较,高通量测序可以更加全面、快速获得中药饮片中的微生物信息和群落特征.
文献关键词：
高通量测序;中药饮片;微生物污染;群落特征;耐胆盐微生物;16S rRNA
中图分类号：
作者姓名：
陈柯;陈敏;林黎;邹惠亮
作者机构：
湖州市食品药品检验研究院,浙江 湖州 313000
文献出处：
引用格式：
[1]陈柯;陈敏;林黎;邹惠亮-.基于16S rRNA高通量测序分析9种中药饮片污染微生物群落特征)[J].中医药导报,2022(09):53-56,61
A类：
耐胆盐微生物
B类：
16S,rRNA,高通量测序分析,中药饮片,微生物群落特征,核糖体,湖州市,市南,南太湖,太湖地区,中华人民共和国药典,柴胡,白术,山药,玄参,麦冬,栀子,砂仁,铁皮,金银花,控制菌检查,检查和,分类鉴定,高通量测序法,基因序列,库比,多样性分析,药检,沙门菌,大肠埃希菌,革兰氏阴性菌,菌落,共获,阴沟肠杆菌,铜绿假单胞菌,阪崎克罗诺杆菌,沙门氏菌,肺炎克雷伯氏菌,鲍曼不动杆菌,奇异变形杆菌,条件致病菌,生物种类,药具,Chaol,Shannon,Simpson,优势菌,肠杆菌属,假单胞菌属,泛菌属,不动杆菌属,克雷伯氏菌属,芽孢杆菌属,葡萄球菌属,链球菌属,肠球菌属,微生物污染,致病风险,平板培养
AB值：
0.279572
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