典型文献
藏药兔耳草常用基原的ITS2序列鉴定研究
文献摘要：
目的 利用DNA条形码内转录间隔区2(internal transcribed spacer2,ITS2)序列针对自采及流通使用环节的不同基原兔耳草进行分析,建立一种快速鉴定常用兔耳草的方法,并分析市场流通的主流品种.方法 采用试剂盒提取101份兔耳草样品的DNA,针对其ITS2片段进行PCR扩增并双向测序,获取ITS2序列信息;并从GenBank上下载相关序列28条.运用MEGA6.0对129条ITS2序列进行比对分析,计算种内和种间K2P遗传距离,构建邻接法(neighborjoining,NJ)系统进化树,并预测ITS2二级结构.采用BLAST法及NJ聚类分析法分析市场流通兔耳草基原.结果 除四川部分区域所产全缘兔耳草Lagotis integra与革叶兔耳草L.alutacea种间亲缘关系近外,短筒兔耳草L.brevituba、全缘兔耳草、圆穗兔耳草L.ramalana、革叶兔耳草、短穗兔耳草L.brachystachya及紫叶兔耳草L.praecox的种内最大遗传距离均小于种间最小遗传距离,具有明显的条形码间距.系统进化树显示短筒兔耳草、圆穗兔耳草、短穗兔耳草及紫叶兔耳草单独聚为一支,四川部分区域所产全缘兔耳草与革叶兔耳草聚为一支,其余全缘兔耳草聚为一支.通过ITS2二级结构发现,各基原兔耳草在茎环数目、大小及位置均有一定差异,可区分亲缘关系近的全缘兔耳草与革叶兔耳草.市场分析显示,市面上流通的兔耳草有6种基原,以全缘兔耳草使用占比最高,短筒兔耳草次之,短穗兔耳草及圆穗兔耳草较低,紫叶兔耳草及革叶兔耳草最低.结论 ITS2序列可以作为DNA条形码用来鉴别常用藏药兔耳草的基原,市场主流兔耳草品种为全缘兔耳草、短筒兔耳草及短穗兔耳草.
文献关键词：
兔耳草;ITS2序列;短筒兔耳草;全缘兔耳草;圆穗兔耳草;革叶兔耳草;短穗兔耳草;紫叶兔耳草;主流品种
中图分类号：
作者姓名：
高必兴;齐景梁;钟红;马璐琳;李倩;连艳;蒋桂华;蒋运斌
作者机构：
成都中医药大学药学院,四川成都 611137;四川省药品检验研究院国家药品监督管理局中成药质量评价重点实验室,四川成都 611731;成都市郫都区中医医院,四川 成都 611730;西南大学药学院/中医药学院,重庆 北碚 400715
文献出处：
引用格式：
[1]高必兴;齐景梁;钟红;马璐琳;李倩;连艳;蒋桂华;蒋运斌-.藏药兔耳草常用基原的ITS2序列鉴定研究)[J].中草药,2022(21):6857-6864
A类：
spacer2,neighborjoining,全缘兔耳草,Lagotis,革叶兔耳草,alutacea,短筒兔耳草,brevituba,圆穗兔耳草,ramalana,brachystachya,紫叶兔耳草
B类：
藏药,基原,ITS2,序列鉴定,鉴定研究,条形码,内转录间隔区,internal,transcribed,流通使用,使用环节,快速鉴定,定常,市场流通,主流品种,试剂盒,草样,序列信息,GenBank,下载,相关序列,MEGA6,比对分析,种内,种间,K2P,遗传距离,邻接,接法,NJ,系统进化树,二级结构,BLAST,聚类分析法,integra,亲缘关系,短穗兔耳草,praecox,市场分析,市面上,上流
AB值：
0.134556
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