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基于DNA条形码鉴别缘毛紫菀及狭苞紫菀
文献摘要：
目的 基于ITS2和rbcL序列对来自不同地理环境的缘毛紫菀Aster souliei及狭苞紫菀A.farreri进行分子鉴定.方法 以ITS2和rbcL的特异性引物,扩增缘毛紫菀及狭苞紫菀的ITS2和rbcL的序列并测定,运用MEGA7.0软件进行多重比对分析和种间种内遗传距离分析,构建邻接法(neigbor-joining,NJ)系统发育树.结果 ITS2序列在缘毛紫菀及狭苞紫菀的变异位点较rbcL序列丰富,且种间与种内的变异位点数无交叉;ITS2序列的NJ树可将缘毛紫菀及狭苞紫菀样品进行有效区分,而rbcL序列构建的系统发育树无法使缘毛紫菀及狭苞紫菀样品得到有效的区分;ITS2及rbcL序列的遗传距离结果显示缘毛紫菀之间的遗传距离很近,而狭苞紫菀之间的遗传距离较远.结论 ITS2较rbcL序列更适合用于不同产地的缘毛紫菀及狭苞紫菀样品的鉴定;狭苞紫菀的种内差异较大.
文献关键词：
缘毛紫菀;狭苞紫菀;ITS2序列;rbcL序列;分子鉴定
中图分类号：
作者姓名：
赵日杂;张英秀;王君军;苏学燕;张绍山;张志锋
作者机构：
西南民族大学药学院四川省羌彝药用资源保护与利用技术工程实验室,四川成都 610225
文献出处：
引用格式：
[1]赵日杂;张英秀;王君军;苏学燕;张绍山;张志锋-.基于DNA条形码鉴别缘毛紫菀及狭苞紫菀)[J].中草药,2022(19):6167-6173
A类：
缘毛紫菀,狭苞紫菀,neigbor
B类：
条形码,ITS2,rbcL,地理环境,Aster,souliei,farreri,分子鉴定,特异性引物,MEGA7,比对分析,种间,间种,种内,遗传距离,邻接,接法,joining,NJ,系统发育树,变异位点,较远,不同产地
AB值：
0.17393
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