典型文献
基于ITS2和psbA-trnH序列鉴别金线兰及其近缘种
文献摘要：
目的 应用ITS2和psbA-trnH条形码鉴定金线兰Anoectochilus roxburghii及其近缘种.方法 提取金线兰及其近缘种的DNA,对ITS2和psbA-trnH序列进行扩增和测序,计算物种种内、种间遗传距离,构建邻接法(neighbor-joining,NJ)系统聚类树直观反映鉴定结果.结果 经PCR扩增后测序,金线兰及其近缘种ITS2序列长度为250～254 bp,GC含量为48.2％～51.6％;psbA-trnH序列长度为636～704 bp,GC含量为31.8％～32.0％.根据K2P遗传距离计算,金线兰的种内遗传距离明显小于种间遗传距离.基于ITS2序列构建的NJ树结果显示,除长片金线兰A.longilobus外,金线兰与其余混伪品可以明显区分.基于psbA-trnH序列构建的NJ树结果显示,除长片金线兰和丽蕾金线兰A.lylei外,金线兰与其余金线兰属近缘种可以明显区分.结论 ITS2和psbA-trnH序列可以鉴别金线兰与其遗传距离较远的近缘种.
文献关键词：
金线兰属;金线兰;DNA条形码;ITS2序列;psbA-trnH序列
中图分类号：
作者姓名：
吴岩斌;张超;吴建国;吴锦忠;郑承剑
作者机构：
福建中医药大学药学院,福建福州 350122;海军军医大学药学系中药鉴定学教研室,上海 200433
文献出处：
引用格式：
[1]吴岩斌;张超;吴建国;吴锦忠;郑承剑-.基于ITS2和psbA-trnH序列鉴别金线兰及其近缘种)[J].中草药,2022(18):5807-5812
A类：
longilobus,lylei,金线兰属
B类：
ITS2,psbA,trnH,近缘种,条形码,定金,Anoectochilus,roxburghii,种内,种间,遗传距离,邻接,接法,neighbor,joining,NJ,系统聚类,后测,bp,K2P,距离计算,长片,混伪品,较远
AB值：
0.181671
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