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马尾松生长性状显著关联标记PCZ090所在基因的挖掘与生物信息学分析
文献摘要：
马尾松(Pinus massoniana)是我国南方重要的用材树种.基于马尾松生长性状候选基因组关联分析,得到显著关联的SSR标记位点PCZ090,通过生物信息学分析方法挖掘其所在基因的全长序列及生理功能.结果表明,基因全长1636 bp,包含1个795 bp的开放阅读框,编码264个氨基酸,蛋白质分子量为30.88 kDa,理论等电点为9.27;参与谷胱甘肽代谢过程,具有谷胱甘肽转移酶活性.通过NCBI CDD进一步确定PCZ090所在基因是谷胱甘肽S-转移酶家族蛋白成员,命名为PmGSTTCHQD1,根据同源基因的注释结果,推测该基因可能参与了催化氯代异源物质的代谢过程,在细胞解毒机制中具有重要作用.该研究结果对于解析细胞解毒能力对马尾松生长的影响具有重要的参考价值.
文献关键词：
基因组关联分析;SSR;生长性状;马尾松;谷胱甘肽S-转移酶
中图分类号：
作者姓名：
罗群凤;吴志铭;冯源恒;龚桂芳;杨章旗
作者机构：
广西壮族自治区林业科学研究院 广西优良用材林资源培育重点实验室 广西马尾松工程技术研究中心,广西南宁 530002
文献出处：
引用格式：
[1]罗群凤;吴志铭;冯源恒;龚桂芳;杨章旗-.马尾松生长性状显著关联标记PCZ090所在基因的挖掘与生物信息学分析)[J].广西林业科学,2022(02):184-189
A类：
PCZ090,PmGSTTCHQD1
B类：
马尾松,生长性状,关联标记,生物信息学分析,Pinus,massoniana,用材树种,候选基因,基因组关联分析,SSR,全长,生理功能,bp,开放阅读框,分子量,kDa,等电点,谷胱甘肽代谢,代谢过程,谷胱甘肽转移酶,NCBI,CDD,同源基因,氯代,异源,解毒机制
AB值：
0.294746
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