典型文献
暴马桑黄倍半萜合酶基因SbTps2克隆及其响应茉莉酸甲酯的表达分析
文献摘要：
[目的]对参与暴马桑黄Sanghuangporus baumii倍半萜合成途径的关键基因SbTps2及其启动子进行克隆和生物信息学分析,并解析不同浓度MeJA对该基因表达的影响.[方法]利用PCR扩增技术克隆暴马桑黄倍半萜合酶基因SbTps2 cDNA全长和启动子序列;用SWISS-MODEL、SignalP-3.0和SOPMA等软件对SbTps2基因和SbTps2启动子序列进行生物信息学分析;以暴马桑黄为试验材料,利用实时荧光定量技术,对不同浓度MeJA诱导下SbTps2基因相对表达量进行了比较分析.[结果]经测序,SbTps2基因全长1227 bp,编码407个氨基酸,蛋白分子量为45.73 kDa.根据暴马桑黄基因组已知的序列,并结合SbTps2基因cDNA测序结果分析基因的外显子和内含子表明,SbTps2基因包含3个外显子(核苷酸0～527 bp、592～898 bp和953～1348 bp)和两个内含子(528～591 bp和899～952 bp);SbTps2蛋白无跨膜结构与信号肽,该蛋白为亲水性不稳定蛋白.系统发育进化树分析结果表明,SbTps2蛋白与已报道的倍半萜合酶基因聚为一支;SbTps2启动子(1220 bp)生物信息学分析结果表明,它含有典型的启动子元件,如CAAT-box、TATA-box和MeJA等其他反应元件.荧光定量分析结果表明,SbTps2基因转录水平在不同浓度MeJA诱导时有差异性,并且在MeJA诱导浓度为200μM时SbTps2基因转录水平达到最高状态.[结论]通过对SbTps2基因的克隆与表达分析,为后续暴马桑黄倍半萜合酶基因功能的研究奠定了基础.
文献关键词：
暴马桑黄;倍半萜合酶基因;基因克隆;启动子克隆;MeJA;诱导表达
中图分类号：
作者姓名：
乌木提·巴合提别克;李亚伟;佟鑫宇;朱丽颖;邹莉
作者机构：
东北林业大学林学院,黑龙江哈尔滨 150040
文献出处：
引用格式：
[1]乌木提·巴合提别克;李亚伟;佟鑫宇;朱丽颖;邹莉-.暴马桑黄倍半萜合酶基因SbTps2克隆及其响应茉莉酸甲酯的表达分析)[J].中南林业科技大学学报,2022(10):158-167
A类：
暴马桑黄,倍半萜合酶基因,SbTps2
B类：
茉莉酸甲酯,表达分析,Sanghuangporus,baumii,合成途径,关键基因,生物信息学分析,MeJA,cDNA,全长,启动子序列,SWISS,MODEL,SignalP,SOPMA,定量技术,基因相对表达量,bp,分子量,kDa,外显子,内含子,膜结构,信号肽,亲水性,系统发育进化树,进化树分析,CAAT,box,TATA,反应元件,基因转录水平,克隆与表达,基因功能,基因克隆,启动子克隆,诱导表达
AB值：
0.187529
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