典型文献
粗枝云杉病程相关蛋白基因PaPR10的克隆及表达分析
文献摘要:
为了探究粗枝云杉(Picea asperata)病程相关蛋白PR10的核糖核酸酶活性,该研究以粗枝云杉一年生针叶为材料,以响应云杉落针病菌(Lophodermium piceae)侵染而显著上调的一个PR10基因(PaPR10)序列为研究对象,设计特异性引物,采用RT-PCR技术克隆获得PaPR10基因的cDNA序列全长,使用生物信息学软件预测该基因编码蛋白的序列特征,将该基因进行原核表达和纯化,利用底物法检测纯化蛋白的核糖核酸酶活性,为解析PR10基因的抗菌活性机理奠定基础.结果表明:(1)成功克隆到PaPR10基因(GenBank登录号为OM743228)的ORF长456 bp,编码151个氨基酸序列,相对分子量为16.52 kD,理论等电点为5.73.(2)PaPR10蛋白无信号肽、不含跨膜区、定位在细胞质中,具有典型的病程相关蛋白Bet_v_1家族保守结构域和一个富含甘氨酸环(P-Loop)的保守结构域,但PaPR10蛋白的P-Loop结构域存在一个碱基突变;PaPR10蛋白与北美云杉等多种裸子植物和部分苔藓植物的PR10蛋白相似性较高.(3)IPTG诱导下,PaPR10蛋白以可溶性蛋白和包涵体的形式并存,且以终浓度为0.8 mmol/L的IPTG在30℃下诱导10 h时表达量最佳,但纯化后的PaPR10可溶性蛋白没有核糖核酸酶活性.研究发现,PaPR10蛋白不具备核糖核酸酶活性.
文献关键词:
粗枝云杉;病程相关蛋白;克隆表达;生物信息学分析;核糖核酸酶活性
中图分类号:
作者姓名:
梁芳;刘利娟;李成松;赵炜栋;刘应高;杨春琳
作者机构:
四川农业大学林学院,成都 611130
文献出处:
引用格式:
[1]梁芳;刘利娟;李成松;赵炜栋;刘应高;杨春琳-.粗枝云杉病程相关蛋白基因PaPR10的克隆及表达分析)[J].西北植物学报,2022(09):1450-1459
A类:
PaPR10,Lophodermium,OM743228
B类:
粗枝云杉,病程相关蛋白,表达分析,Picea,asperata,核糖核酸酶活性,一年生,针叶,落针病,piceae,侵染,特异性引物,cDNA,全长,生物信息学软件,软件预测,基因编码,编码蛋白,序列特征,原核表达,底物,抗菌活性,GenBank,登录号,ORF,bp,氨基酸序列,相对分子量,kD,等电点,信号肽,细胞质,Bet,保守结构域,甘氨酸,Loop,碱基突变,北美,裸子植物,苔藓植物,白相,IPTG,可溶性蛋白,包涵体,克隆表达,生物信息学分析
AB值:
0.274138
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