典型文献
光皮桦BlBLH1基因的克隆、表达及互作蛋白筛选
文献摘要：
[目的]BLH基因家族是广泛存在于植物中的转录因子,其与KNOX等转录因子的互作被认为在植物的次生壁发育中起重要调控作用.本研究拟克隆光皮桦BlBLH1基因,分析其表达模式,并筛选能与其互作的蛋白.[方法]利用Blast等软件在光皮桦基因组序列中鉴定获得BlBLH1序列,克隆验证后对其进行多序列比对、系统进化等生物信息学分析;利用实时荧光定量PCR分析BlBLH1在光皮桦不同组织、器官和应拉木形成中的表达模式;通过酵母双杂交技术筛选BlBLH1互作的蛋白,并采用双分子荧光互补实验(BiFC)进一步验证其与部分蛋白在拟南芥细胞内的互作.[结果]BlBLH1基因序列全长为2128 bp,开放阅读框(ORF)为1830 bp,编码609个氨基酸,具有SKY、BEL和HD 3个保守结构域.系统进化分析显示,BlBLH1与拟南芥BLH1有最近的同源关系.表达分析显示BlBLH1在雄花序中的表达量最高;在木质化茎段中的表达量次之;在应拉木诱导过程中,BlBLH1在应拉木中的表达量均显著高于对照.通过酵母双杂交筛选获得结构蛋白、酶、转录因子等47个与BlBLH1互作较强的蛋白;BiFC验证结果表明,BlBLH1与BlKNOX4、BlKNOX9在拟南芥原生质体内存在互作关系.而且,三者在茎段和应拉木的表达趋势基本一致.[结论]可从光皮桦中分离获得BlBLH1基因,生物信息学、表达和蛋白互作分析的结果表明BlBLH1参与光皮桦木材形成过程,且存在与KNOX蛋白的互作关系.
文献关键词：
BlBLH1;次生壁;酵母双杂交;双分子荧光互补
中图分类号：
作者姓名：
庄和必;俞子承;林二培;黄华宏
作者机构：
浙江农林大学 亚热带森林培育国家重点实验室 杭州 311300
文献出处：
引用格式：
[1]庄和必;俞子承;林二培;黄华宏-.光皮桦BlBLH1基因的克隆、表达及互作蛋白筛选)[J].林业科学,2022(03):59-68
A类：
BlBLH1,BLH,SKY,BLH1,BlKNOX4,BlKNOX9
B类：
光皮桦,互作蛋白筛选,基因家族,次生壁,表达模式,Blast,基因组序列,多序列比对,生物信息学分析,不同组织,应拉木,酵母双杂交技术,技术筛选,双分子荧光互补实验,BiFC,拟南芥,基因序列,全长,bp,开放阅读框,ORF,BEL,HD,保守结构域,系统进化分析,表达分析,雄花,花序,木质化,茎段,结构蛋白,原生质体,互作关系,蛋白互作分析,桦木,木材形成
AB值：
0.231036
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