典型文献
油茶转录因子基因CoSOC1-like的克隆和表达分析
文献摘要：
[目的]克隆油茶的SOC1同源基因(CoSOC1-like),分析其序列特征和表达模式及其蛋白进化.[方法]以3年生油茶嫩叶为材料提取RNA,利用RT-PCR和RACE方法克隆油茶的CoSOC1-like基因,用生物信息学工具分析其序列特征,用荧光定量PCR分析其表达模式,用基因瞬时表达法分析其蛋白的亚细胞定位.[结果]油茶CoSOC1-like基因的CDS全长为654?bp,推测蛋白质由127个氨基酸组成,蛋白分子量为24.958?kD,等电点(pI)为6.8,基因库的登录号为MT036382.CoSOC1-like具有植物Ⅱ型MADS-box基因的蛋白结构,且C末端含有MOTIF结构域,是一个MADS-box家族转录因子.CoSOC1-like蛋白有31个磷酸化位点,建立在二级结构基础上的CoSOC1-like蛋白的三级结构具有明显活性部位;CoSOC1-like基因瞬时表达分析表明,油茶CoSOC1-like蛋白定位于细胞核,符合转录因子的细胞核定位特征.系统进化分析表明:油茶CoSOC1-like与茶树SOC1-like蛋白聚类在同一个进化支上.荧光定量PCR分析表明:CoSOC1-like基因存在于油茶所有的器官中,尤其在花芽中的相对表达量最多.[结论]CoSOC1-like基因在油茶的花芽分化中起重要作用,也可能参与根、茎、叶和种子等器官的生长发育.本结果为进一步研究油茶成花的分子机制奠定了基础.
文献关键词：
油茶;SOC1-like;克隆;序列分析;表达分析
中图分类号：
作者姓名：
黄国文;管天球;赵雨云;陈莫林;刘宏辉
作者机构：
湖南科技学院化生院,湖南 永州 425199
文献出处：
引用格式：
[1]黄国文;管天球;赵雨云;陈莫林;刘宏辉-.油茶转录因子基因CoSOC1-like的克隆和表达分析)[J].林业科学研究,2022(02):129-139
A类：
CoSOC1,MT036382,MOTIF
B类：
油茶,like,表达分析,同源基因,序列特征,表达模式,生油,嫩叶,RACE,生物信息学工具,瞬时表达,表达法,亚细胞定位,CDS,全长,bp,氨基酸组成,分子量,kD,等电点,pI,基因库,登录号,MADS,box,蛋白结构,结构域,磷酸化,二级结构,三级结构,活性部位,蛋白定位,细胞核,核定,系统进化分析,茶树,同一个,相对表达量,花芽分化,成花,序列分析
AB值：
0.271404
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