典型文献
马尾松蔗糖磷酸合酶基因的克隆和表达分析
文献摘要:
通过挖掘4个马尾松蔗糖磷酸合酶基因(PmSPS1~PmSPS4),探究SPS基因在马尾松中的表达特性及功能.利用马尾松转录组数据挖掘SPS基因,对基因进行克隆及生物信息学分析,用实时荧光定量PCR检测其在马尾松不同组织、高低产脂种质和低磷胁迫中的相对表达量.结果从马尾松针叶中克隆获得4个SPS基因,开放阅读框(open reading frame,ORF)长度为1701~3243 bp,编码566~1080个氨基酸.进化分析表明,PmSPS1和PmSPS3同属A亚族,PmSPS2和PmSPS4同属B亚族.组织特异性分析发现,PmSPS2和PmSPS4在针叶中表达量最高,PmSPS1和PmSPS3在树皮中表达量最高;PmSPS1和PmSPS3在幼嫩组织和成熟组织表达差异不显著,PmSPS2和PmSPS4在成熟针叶中的表达量显著高于嫩叶(P<0.05),在嫩茎和成熟茎间差异不显著.PmSPS1和PmSPS3的表达量在高、低产脂种质中差异不显著,PmSPS2和PmSPS4在高产脂种质针叶中的表达水平高于低产脂,在高产脂木质部中低于低产脂.低磷胁迫处理后,4个PmSPS基因在针叶中的表达水平均为上调,其中PmSPS2基因表达量最高,达到对照组的3.18倍.综合以上分析结果,克隆得到的4个马尾松SPS基因分布于A、B亚族中,不同亚族基因呈现出不同的表达特性,为后续深入研究SPS家族基因在马尾松中的功能提供了理论依据.
文献关键词:
马尾松;蔗糖合成;蔗糖磷酸合酶;组织;低磷胁迫
中图分类号:
作者姓名:
吴荣菊;文晓鹏;李正春;梅利那;申洛男;吴泽英
作者机构:
贵州大学生命科学学院, 贵州 贵阳550025;贵州大学农业生物工程研究院,贵州 贵阳550025;贵州大学林学院, 贵州 贵阳550025
文献出处:
引用格式:
[1]吴荣菊;文晓鹏;李正春;梅利那;申洛男;吴泽英-.马尾松蔗糖磷酸合酶基因的克隆和表达分析)[J].森林与环境学报,2022(02):199-207
A类:
PmSPS1,PmSPS4,PmSPS3,PmSPS2,PmSPS
B类:
马尾松,蔗糖磷酸合酶,酶基因,表达分析,表达特性,转录组数据,生物信息学分析,不同组织,低产,产脂,低磷胁迫,相对表达量,松针,针叶,开放阅读框,open,reading,frame,ORF,bp,进化分析,同属,组织特异性,树皮,幼嫩,组织表达差异,嫩叶,嫩茎,成熟茎,木质部,胁迫处理,基因表达量,基因分布,家族基因,蔗糖合成
AB值:
0.21728
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