典型文献
黑果枸杞GRF转录因子家族鉴定与生物信息学分析
文献摘要：
为探究黑果枸杞(Lycium ruthenicum)GRF基因家族成员在盐胁迫下的耐盐分子机制,采用生物信息学方法,对黑果枸杞转录组数据库进行分析,并对GRF家族成员的理化性质、保守结构域、进化树、基因家族表达谱进行分析.结果表明,通过转录组数据共筛选出14个GRF家族成员,这些蛋白编码氨基酸的个数为136～585 aa,等电点为5.58～9.33,分子量为14.56697～62.98665 kDa.保守基序表明,多数黑果枸杞GRF的N端具有QLQ和WRC保守结构域.系统进化分析发现,14个LrGRFs被分为7个亚族,位于同一亚族的GRF基序组成相似,部分黑果枸杞GRF与番茄GRF具有相对应的进化关系.表达谱表明,不同组织的LrGRFs在不同盐胁迫下均有响应,其中LrGRF6,LrGRF10和LrGRF12在根中高表达,而LrGRF2,LrGRF6和LrGRF10在叶中表现为高表达,这表明其可能在黑果枸杞中发挥着更加重要的调控作用.结果为进一步深入揭示LrGRFs在盐胁迫环境下的分子机制奠定了理论基础.
文献关键词：
黑果枸杞;NaCl胁迫;GRF基因家族;生物信息学;进化树;表达谱分析
中图分类号：
作者姓名：
杜雨;刘筠;胡晓桐;贾西贝;柳迪;马彦军
作者机构：
甘肃农业大学林学院,甘肃 兰州 730070
文献出处：
引用格式：
[1]杜雨;刘筠;胡晓桐;贾西贝;柳迪;马彦军-.黑果枸杞GRF转录因子家族鉴定与生物信息学分析)[J].草地学报,2022(06):1403-1412
A类：
LrGRFs,LrGRF6,LrGRF10,LrGRF12,LrGRF2
B类：
黑果枸杞,生物信息学分析,Lycium,ruthenicum,基因家族,盐胁迫,耐盐分子机制,生物信息学方法,转录组数据,保守结构域,进化树,蛋白编码,aa,等电点,分子量,kDa,保守基序,QLQ,WRC,系统进化分析,番茄,进化关系,谱表,不同组织,胁迫环境,NaCl,表达谱分析
AB值：
0.237465
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