典型文献
基于转录组的油茶DHHC型锌指蛋白基因家族的鉴定及分析
文献摘要：
DHHC型锌指蛋白参与细胞内蛋白质的棕榈酰化修饰,对植物的生长发育、器官形成、生殖发育及胁迫响应等生命活动具有重要的调控作用.基于油茶叶片转录组数据,筛选出23个DHHC型锌指蛋白基因,应用生物信息学方法对其蛋白理化性质、结构域、系统进化等进行了分析.结果 表明,23个DHHC型锌指蛋白的序列大小为195～725 aa,均包含一个保守的DHHC-CRD结构域,大部分DHHC型锌指蛋白具有4个跨膜区,主要定位于细胞核和细胞膜中.系统进化分析将其分为4类,与拟南芥和水稻均有不同程度的同源关系,DHHC型锌指蛋白在不同物种间具有遗传保守性.23个DHHC型锌指蛋白基因在结实量大和结实量小的单株的不同发育时期叶片中均有不同程度的表达.CoDHHC9、CoDHHC13、CoDHHC22在油茶抽梢生长期的叶片中表达上调;CoDHHC6、CoDHHC12、CoDHHC18、CoDHHC23在花芽分化时期和果实成熟时期的叶片中表达量较高,且在结实量较小而开花较多的单株中表达上调更为明显,这些基因可能参与油茶花芽分化及花朵发育过程;CoDHHC5、CoDHHC11、CoDHHC15在不同时期的叶片中表达量均较低.研究结果为进一步对油茶DHHC型锌指蛋白家族基因的克隆和功能分析提供依据,有助于进一步研究该基因家族在油茶生殖发育中的调控功能.
文献关键词：
油茶;DHHC型锌指蛋白家族;蛋白质酰基转移酶;生物信息学分析
中图分类号：
作者姓名：
徐嘉娟;朱亚艳;李芳;许杰;王港
作者机构：
贵州省林业科学研究院,贵州贵阳550005
文献出处：
引用格式：
[1]徐嘉娟;朱亚艳;李芳;许杰;王港-.基于转录组的油茶DHHC型锌指蛋白基因家族的鉴定及分析)[J].西北林学院学报,2022(01):81-88
A类：
CoDHHC9,CoDHHC13,CoDHHC22,CoDHHC6,CoDHHC12,CoDHHC18,CoDHHC23,CoDHHC5,CoDHHC11,CoDHHC15,蛋白质酰基转移酶
B类：
基因家族,白参,棕榈酰化修饰,对植,生殖发育,胁迫响应,生命活动,茶叶,叶片转录组,转录组数据,生物信息学方法,结构域,aa,CRD,细胞核,细胞膜,系统进化分析,拟南芥,水稻,种间,保守性,结实量,单株,不同发育时期,生长期,花芽分化,分化时,果实成熟,成熟时期,开花,油茶花,花朵,锌指蛋白家族,家族基因,功能分析,调控功能,生物信息学分析
AB值：
0.215799
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