典型文献
紫苏硬脂酰-ACP脱氢酶基因家族鉴定及表达分析
文献摘要：
硬脂酰ACP脱氢酶(SAD)催化硬脂酸脱氢生成油酸,是形成不饱和脂肪酸的关键酶.该研究从紫苏转录组数据库中筛选鉴定紫苏硬脂酰ACP脱氢酶(PfSAD)家族基因,并进行生物信息学分析及保守功能域分析,用qRT PCR技术检测PfSADs各成员在不同组织中的表达特性,以探讨PfSAD家族基因在调控种子脂肪酸组分中的作用,为紫苏脂肪酸组分的遗传改良提供基因元件.结果 显示:(1)从该课题组前期自测的紫苏转录组数据库中共检测出6个PfSAD家族基因,其编码蛋白的氨基酸长度介于367～396 aa之间,均具有SAD的保守结构域和二铁中心,预测其基因编码蛋白均定位于叶绿体.(2)多序列比对结果显示,紫苏PfSADs蛋白序列与拟南芥、蓖麻及可可等植物的SAD蛋白序列相似性均在50％以上;系统进化分析显示,6个紫苏SAD蛋白被分为3个亚组,其中第一个亚组包含PfSAD1,第二亚组包含PfSAD2、PfSAD3,第三亚组包含PfSAD4、PfSAD5和PfSAD6.(3)实时荧光定量PCR分析发现,PfSADs各成员在'晋紫苏l号'不同组织中的表达量差异显著,其中PfSADl主要在叶中表达,PfSAD2、PfSAD3、PfSAD4和PfSAD5在种子中表达量较高,PfSAD6在花中具有显著表达优势.研究表明,PfSADs具有典型的保守基序及催化SAD的活性中心,其各成员在不同的组织中高表达,推测这6个基因均参与了硬脂酰ACP(C18∶0-ACP)脱氢生成油酰基ACP(Δ9C18∶1-ACP)的过程,在紫苏油脂合成代谢过程中发挥重要作用.
文献关键词：
紫苏;SAD家族基因;油脂代谢;基因序列特征;表达分析
中图分类号：
作者姓名：
邢志;董书言;王超;周雅莉;杨宏斌;王计平
作者机构：
山西农业大学分子农业与生物能源研究所,山西太谷030801
文献出处：
引用格式：
[1]邢志;董书言;王超;周雅莉;杨宏斌;王计平-.紫苏硬脂酰-ACP脱氢酶基因家族鉴定及表达分析)[J].西北植物学报,2022(01):57-65
A类：
PfSAD,PfSADs,PfSAD1,PfSAD2,PfSAD3,PfSAD4,PfSAD5,PfSAD6,PfSADl,9C18
B类：
ACP,酶基因,基因家族鉴定,表达分析,硬脂酸,生成油,油酸,不饱和脂肪酸,关键酶,转录组数据,筛选鉴定,家族基因,生物信息学分析,功能域,qRT,不同组织,表达特性,脂肪酸组分,遗传改良,自测,编码蛋白,aa,保守结构域,基因编码,叶绿体,多序列比对,拟南芥,蓖麻,可可,系统进化分析,三亚,保守基序,活性中心,酰基,紫苏油,油脂合成,合成代谢,代谢过程,油脂代谢,基因序列特征
AB值：
0.23153
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