WRKY是一类植物特有的转录因子,尤其在植物生长、发育和逆境过程中起到至关重要的作用.为了鉴定盐生草WRKY基因家族成员、揭示其进化关系及探究HgWRKYs基因在盐胁迫下的表达响应模式,本研究基于盐生草全长转录组数据,利用生物信息学方法对其WRKY转录因子进行鉴定与分析,并通过qRT-PCR方法检测了HgWRKYs家族成员在盐胁迫下的相对表达量.结果表明,在盐生草转录组中共鉴定出31个HgWRKYs,氨基酸数介于220～611 aa,其蛋白N端均具有完整的WRKYGQK保守序列;除HgWRKY20和HgWRKY21同时分布于细胞核和线粒体外,其余HgWRKY基因均位于细胞核;系统进化分析将其分为Ⅰ(8个)、Ⅱ(22个)、Ⅲ(1个)三类,第Ⅱ类进一步分为Ⅱ-a(1个)、Ⅱ-b(2个)、Ⅱ-c(1个)、Ⅱ-d(15个)和Ⅱ-e(3个)5个亚类;Motif 1和Motif 2是HgWRKYs基因家族的特征基序,在进化过程中较为保守.qRT-PCR结果表明,HgWRKYs主要在根系中表达,具有组织特异性,其中HgWRKY19、HgWRKY23和HgWRKY27基因在24 h的表达量最高,将其作为盐胁迫响应候选基因,以期为后续研究盐生草WRKY基因响应盐胁迫的分子机制提供依据.

盐生草;WRKY基因家族;盐胁迫;生物信息学

陈倩;徐晓芸;汪军成;姚立蓉;司二静;杨轲;韦晓玲;马小乐;李葆春;尚勋武;孟亚雄;王化俊

省部共建干旱生境作物学国家重点实验室,甘肃省作物遗传改良与种质创新重点实验室,甘肃 兰州730070;甘肃农业大学农学院,甘肃 兰州730070;甘肃农业大学生命科学技术学院,甘肃 兰州730070

草业学报

[1]陈倩;徐晓芸;汪军成;姚立蓉;司二静;杨轲;韦晓玲;马小乐;李葆春;尚勋武;孟亚雄;王化俊-.基于全长转录组的盐生草WRKY基因家族的鉴定及其盐胁迫响应模式分析)[J].草业学报,2022(12):146-157

HgWRKYs,HgWRKY20,HgWRKY21,HgWRKY,HgWRKY19,HgWRKY23,HgWRKY27

全长转录组,盐生草,基因家族,盐胁迫,胁迫响应,响应模式,模式分析,植物生长,逆境,进化关系,转录组数据,利用生物,生物信息学方法,qRT,相对表达量,aa,WRKYGQK,保守序列,细胞核,系统进化分析,亚类,Motif,特征基序,根系,有组织,组织特异性,候选基因

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