典型文献
象草全基因组bHLH转录因子家族鉴定及表达分析
文献摘要:
bHLH转录因子家族不仅参与了植物的生长发育,而且在植物响应逆境胁迫和次生代谢方面发挥着关键作用.在全基因组水平对重要饲草及能源植物象草的bHLH转录因子家族进行了鉴定及分析,并利用转录组数据及定量RT-PCR分析了象草bHLH转录因子对赤霉素(GA3)和多效唑(PAC)的响应.结果显示:在象草中共鉴定出229个具有完整保守结构域的bHLH基因家族成员(CpbHLH001~CpbHLH229),不均匀地分布于14条染色体上;系统进化分析结果表明,229个CpbHLHs可被分为18个亚类,其中C亚类的成员数量最多,为41个;此外,相同亚家族中的大多数基因具有相似的基因结构和保守基序;基于转录组数据的表达谱分析结果发现,多数bHLH基因在象草茎尖组织中均对GA3和PAC有响应.随机挑选9个表达量较高的基因进一步通过qPCR进行验证.结果显示,经外源GA3和PAC处理之后,这9个基因因不同处理而差异表达,表明这9个基因可能与GA3和PAC介导的信号通路有关.综上所述,本研究为象草bHLH转录因子家族的生物学功能奠定了基础.
文献关键词:
象草;bHLH转录因子;基因鉴定;表达分析
中图分类号:
作者姓名:
高莉娟;张正社;文裕;宗西方;闫启;卢丽燕;易显凤;张吉宇
作者机构:
兰州大学草地农业生态系统国家重点实验室,兰州大学农业农村部草牧业创新重点实验室,兰州大学草地农业科技学院,甘肃 兰州 730020;广西农业职业技术学院,广西 南宁 530007;广西畜牧研究所,广西 南宁 530001
文献出处:
引用格式:
[1]高莉娟;张正社;文裕;宗西方;闫启;卢丽燕;易显凤;张吉宇-.象草全基因组bHLH转录因子家族鉴定及表达分析)[J].草业学报,2022(03):47-59
A类:
CpbHLH001,CpbHLH229,CpbHLHs
B类:
象草,全基因组,表达分析,逆境胁迫,次生代谢,代谢方,饲草,能源植物,物象,转录组数据,赤霉素,GA3,多效唑,PAC,保守结构域,基因家族,系统进化分析,亚类,成员数,亚家族,基因结构,保守基序,表达谱分析,茎尖,qPCR,不同处理,差异表达,综上所述,生物学功能,基因鉴定
AB值:
0.282539
相似文献
机标中图分类号,由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成,仅供学习研究参考。