典型文献
蚕豆耐盐相关基因VfHKT1;1的克隆、生物信息学分析及表达特性
文献摘要:
高亲和性钾离子转运蛋白(high affinity K+transporter,HKT)能够调节细胞及整株的Na+/K+转运,在植物盐胁迫调控中发挥着重要作用.采用RT-PCR和PCR方法克隆获得蚕豆VfHKT1;1基因全长编码序列,该基因包含1659 bp的开放阅读框,编码552个氨基酸.系统进化树分析发现,该蛋白属于HKT第Ⅰ亚家族,命名为VfHKT1;1,且VfHKT1;1蛋白氨基酸序列与苜蓿MtHKT1;1的序列相似度最高.生物信息学分析发现,VfHKT1;1蛋白结构稳定,不具有信号肽结构,含有8个跨膜区域,且蛋白含有HKT家族典型的保守结构域TrKH,属于典型的跨膜离子转运体.实时荧光定量PCR分析表明,VfHKT1;1基因的表达具有明显的组织特异性.在盐胁迫诱导下,VfHKT1;1基因在根中的表达水平受到抑制,而在叶片中的表达水平上升,且在盐处理1h后达到最高值,随后随着盐处理时间的延长又逐渐下降.
文献关键词:
蚕豆;基因克隆;生物信息学分析;表达特性
中图分类号:
作者姓名:
樊有存;张红岩;杨旭升;韩芊;刘玉皎;武学霞
作者机构:
青海大学 农林科学院 省部共建三江源生态与高原农牧业国家重点实验室,青海 西宁810000;青海大学 生态环境工程学院,青海西宁810000
文献出处:
引用格式:
[1]樊有存;张红岩;杨旭升;韩芊;刘玉皎;武学霞-.蚕豆耐盐相关基因VfHKT1;1的克隆、生物信息学分析及表达特性)[J].浙江农业学报,2022(04):756-765
A类:
VfHKT1,K+transporter,MtHKT1,TrKH
B类:
蚕豆,耐盐,生物信息学分析,表达特性,亲和性,钾离子,离子转运,转运蛋白,high,affinity,整株,Na+,植物盐,盐胁迫,胁迫调控,全长,长编,编码序列,bp,开放阅读框,系统进化树分析,亚家族,氨基酸序列,苜蓿,蛋白结构,结构稳定,信号肽结构,保守结构域,转运体,组织特异性,盐处理,1h,最高值,处理时间,基因克隆
AB值:
0.302797
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