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典型文献
马铃薯锌转运体基因StZnT2生物信息学及表达特性分析
文献摘要:
锌是植物生长发育所必需的微量元素,缺锌或过量锌都会严重影响植物生长,锌转运蛋白对调节植物体内锌稳态具有重要作用.本研究以马铃薯(Solanum tuberosum)栽培品种'大西洋'试管苗为实验材料,克隆得到马铃薯锌转运体2(Solanum tuberosum zinc transporter 2,StZnT2)(GenBank No.XM_006358632.2)基因.结果表明,该基因全长1294 bp,CDS长1011 bp,编码336个氨基酸,蛋白相对分子量为36682.78 kD,理论等电点为5.63,属于疏水性跨膜蛋白,具有典型的ZIP保守结构域;亚细胞定位结果显示该蛋白定位于细胞膜上.同源蛋白比对分析表明,StZnT2基因编码的蛋白质与潘那利番茄(S.pen?nellii)、番茄(S.lycopersicum)和科民茄(S.commersonii)相似度最高.马铃薯在缺乏锌和过量锌培养条件下均表现出植株矮小、根系伸长受到抑制.实时荧光定量PCR分析不同锌浓度胁迫下基因的表达模式,结果表明,StZnT2在缺锌和过量锌胁迫下表达量均上调,且在根中表达水平最高.本研究结果为进一步阐明马铃薯StZnT2基因功能提供理论依据.
文献关键词:
锌;马铃薯;马铃薯锌转运体2 (StZnT2);生物信息学;表达模式
作者姓名:
尹科;赵婧;唐勋;赵贵宾;朱永永;党伟英;张宁;司怀军
作者机构:
甘肃农业大学生命科学技术学院,兰州730070;甘肃省干旱生境作物学省部共建国家重点实验室,兰州730070;甘肃省农业信息中心,兰州730030;甘肃省农业技术推广总站,兰州730020
引用格式:
[1]尹科;赵婧;唐勋;赵贵宾;朱永永;党伟英;张宁;司怀军-.马铃薯锌转运体基因StZnT2生物信息学及表达特性分析)[J].农业生物技术学报,2022(09):1676-1686
A类:
StZnT2,潘那利番茄,nellii,commersonii
B类:
马铃薯,锌转运体,表达特性,植物生长发育,微量元素,缺锌,锌转运蛋白,植物体,Solanum,tuberosum,栽培品种,大西洋,试管苗,实验材料,zinc,transporter,GenBank,No,XM,全长,bp,CDS,白相,相对分子量,kD,等电点,疏水性,跨膜蛋白,ZIP,保守结构域,亚细胞定位,定位结果,蛋白定位,细胞膜,同源蛋白,比对分析,基因编码,pen,lycopersicum,培养条件,植株,矮小,根系,伸长,表达模式,锌胁迫,基因功能
AB值:
0.355305
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