典型文献
辣椒CaTPS8基因克隆与表达分析
文献摘要：
海藻糖-6-磷酸合酶(Trehalose-6-phosphate synthase,TPS)在植物非生物胁迫响应中起着重要的调控作用.以辣椒品种'强丰101'为材料,对CaTPS8基因进行克隆和表达分析.结果表明,该基因CDS的完整开放阅读框为2 553 bp,编码850个氨基酸.生物信息学分析发现,CaTPS8蛋白的分子质量为96 ku,理论等电点为5.65,不稳定系数为48.09,推测为不稳定蛋白.蛋白结构预测显示CaTPS8蛋白包含Glyco_transf_20和GT20_TPS两个保守结构域,属于亲水性蛋白,没有跨膜结构和信号肽序列.二级、三级结构预测表明该蛋白的结构主要为α-螺旋和无规则卷曲.系统进化关系分析表明,CaTPS8蛋白与马铃薯和番茄的同源性最高,其相似度分别为87.78％和86.92％,与高粱的同源序列相似度最低,为64.76％.实时荧光定量PCR分析表明,CaTPS8基因在辣椒花中表达量最高.同时,CaTPS8基因的表达受到低温的诱导,在处理3 h时相对表达量最高,约为对照的25倍.此外,IAA、ABA、SA、GA3和MeJA处理能够抑制CaTPS8基因的表达.研究结果为进一步阐明CaTPS8基因响应辣椒非生物胁迫的分子机理奠定基础.
文献关键词：
辣椒;CaTPS8;基因克隆;表达分析;生物信息学
中图分类号：
作者姓名：
赵淑芳;苟秉调;魏敏;段盼盼;王永富;杨楠;张高原;魏兵强
作者机构：
甘肃农业大学园艺学院,兰州 730070
文献出处：
引用格式：
[1]赵淑芳;苟秉调;魏敏;段盼盼;王永富;杨楠;张高原;魏兵强-.辣椒CaTPS8基因克隆与表达分析)[J].西北农业学报,2022(12):1568-1578
A类：
CaTPS8,transf,GT20
B类：
基因克隆与表达,表达分析,海藻糖,Trehalose,phosphate,synthase,非生物胁迫,胁迫响应,辣椒品种,CDS,开放阅读框,bp,生物信息学分析,分子质量,ku,等电点,不稳定系数,蛋白结构,结构预测,白包,Glyco,保守结构域,亲水性,膜结构,信号肽,肽序列,三级结构,无规则,卷曲,系统进化,进化关系,关系分析,马铃薯,番茄,同源性,高粱,相对表达量,IAA,ABA,SA,GA3,MeJA,分子机理
AB值：
0.354804
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