典型文献
质体系统发育基因组解析旋花科系统发育关系
文献摘要：
旋花科是一个世界广布的类群,具有丰富的形态特征和重要的经济价值.然而,目前该科主要分支或族间的系统发育关系问题一直未解决.为解析旋花科内系统发育关系,该研究代表性选取旋花科内8个族40个物种,基于质体全基因组数据,使用最大似然法和贝叶斯推论进行系统发育分析.结果表明:(1)旋花科质体基因组均为四分体结构,质体基因组大小为113273～164112 bp,蛋白质编码基因数目为66～79个.(2)基于五种DNA矩阵(即WCG、CDS、LSC、IR、SSC)的系统发育分析结果显示,WCG矩阵和CDS矩阵的拓扑结构基本一致,仅少数分支的支持率略有差异;LSC矩阵和WCG矩阵的拓扑结构差异在于菟丝子族、马蹄金族和盐帚花族的系统位置;AU检验和SH检验结果显示,WCG矩阵和SSC矩阵与IR矩阵的拓扑结构有显著冲突.(3)所有系统发育分析结果均显示,菟丝子属和马蹄金族都包括在旋花亚科内,应处理为族等级.(4)基于WCG矩阵和CDS矩阵较好地解决了旋花科8个族之间的系统发育关系,即心被藤族和丁公藤族聚为一支,最先从旋花亚科分化出来,随后是菟丝子族,剩下的5个族分成2个分支.(5)系统发育基因组分析证实,由于鱼黄草族特别是鱼黄草属是一个多系类群,因此需重新修订该族的分类地位和鱼黄草属的划分.
文献关键词：
旋花科;系统发育关系;质体基因组;菟丝子属;鱼黄草族
中图分类号：
作者姓名：
陈丽琼;张志荣;杨俊波;李德铢;郁文彬
作者机构：
中国科学院西双版纳热带植物园 综合保护中心,云南 勐腊 666303;中国科学院大学,北京 100049;中国科学院昆明植物研究所 中国西南野生生物种质资源库,昆明 650201;中国科学院核心植物园保护生物学协同中心,云南 勐腊 666303;中国科学院东南亚生物多样性研究中心,云南 勐腊 666303
文献出处：
引用格式：
[1]陈丽琼;张志荣;杨俊波;李德铢;郁文彬-.质体系统发育基因组解析旋花科系统发育关系)[J].广西植物,2022(10):1740-1749
A类：
鱼黄草族
B类：
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AB值：
0.316831
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