典型文献
人参属植物叶绿体基因组特征及其进化的研究
文献摘要：
[目的]对人参属(Panax L.)物种叶绿体基因组特征及其系统发育进行研究,为我国人参属资源的遗传学研究和开发利用提供理论依据.[方法]基于14种人参属植物叶绿体基因组序列,利用生物信息学软件,对叶绿体基因组特征、序列重复、结构变异、基因进化和系统发育进行分析.[结果]人参属物种叶绿体基因组均为典型的四分体结构,包含114个unique基因.长重复序列主要为回文重复和正向重复,30～39 bp的重复序列最多,SSR大多为A/T重复,单核苷酸重复是最丰富的类型.人参属叶绿体基因组未发生基因重排,反向重复区(IR)与单拷贝区边界高度保守,鉴定的12个核苷酸高度可变热点中7个位于大单拷贝(LSC)区,5个位于小单拷贝(SSC)区.根据dN/dS比率,发现功能未知基因clpP、ycf1和ycf2受正选择作用.系统发育分析显示,屏边三七和三叶参位于基部支系,四倍体人参和西洋参与其他二倍体物种聚在不同支系,三七、竹节参和越南参则亲缘关系较近.[结论]人参属叶绿体基因组基因数目和顺序一致,基因组结构保守,重复序列数目和类型存在差异,单拷贝区核苷酸多态性高于IR区,正选择基因可能与物种的生态适应性有关.
文献关键词：
人参属;叶绿体基因组;重复;变异;系统发育
中图分类号：
作者姓名：
刘潮;李敏;任怡园;钱柏霖;韩利红
作者机构：
曲靖师范学院生物资源与食品工程学院/云南省高校特色果酒技术创新与应用工程研究中心,云南 曲靖 655011
文献出处：
引用格式：
[1]刘潮;李敏;任怡园;钱柏霖;韩利红-.人参属植物叶绿体基因组特征及其进化的研究)[J].福建农业学报,2022(07):886-896
A类：
B类：
人参属,植物叶,叶绿体基因组,基因组特征,Panax,遗传学研究,研究和开发,基因组序列,利用生物,生物信息学软件,结构变异,基因进化,四分体,分体结构,unique,重复序列,回文,bp,SSR,单核苷酸,基因重排,重复区,拷贝,变热,点中,个位,LSC,SSC,dN,dS,clpP,ycf1,ycf2,正选择,选择作用,系统发育分析,屏边三七,三叶,基部,支系,四倍体,西洋参,二倍体,体物,同支,竹节参,越南,亲缘关系,和顺,基因组结构,多态性,生态适应性
AB值：
0.366662
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