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铁皮石斛叶绿体基因组特征与系统发育分析
文献摘要：
采用Illumina Hiseq平台高通量测序,对药用植物铁皮石斛进行叶绿体全基因组序列测序、注释、组装及结构分析,从NCBI中下载已发表的13个兰科植物以及2个外类群进行系统发育分析.结果表明,全基因组大小为153 508 bp,大单拷贝区域为85 759 bp,小单拷贝区域为14 973 bp,两个反向重复区域为26 419 bp;共注释133个基因,93个蛋白编码基因,32个转运RNA基因以及8个核糖体rRNA基因,GC的含量占总碱基数量的37.51％;共检测到47个长重复序列,63个简单重复序列;系统发育结果与石斛亲缘性最近.
文献关键词：
铁皮石斛;叶绿体基因组;重复序列;系统发育
中图分类号：
作者姓名：
楼天灵;袁莉霞;张国芳;吴浩;沈岚
作者机构：
浙江药科职业大学,浙江宁波315100;宁波市农业科学研究院,浙江宁波315100
文献出处：
引用格式：
[1]楼天灵;袁莉霞;张国芳;吴浩;沈岚-.铁皮石斛叶绿体基因组特征与系统发育分析)[J].种子,2022(08):35-41
A类：
B类：
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AB值：
0.322981
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