典型文献
抱茎金花茶(Camellia tienii)的叶绿体基因组特征分析
文献摘要：
为明确抱茎金花茶(Camellia tienii)的叶绿体全基因组序列,本研究对抱茎金花茶的叶片高通量重测序数据进行叶绿体全基因组的组装和注释分析.抱茎金花茶叶绿体全基因组长为156591 bp,是典型的四分体结构,大单拷贝区(LSC)为86172 bp、小单拷贝区(SSC)为18275 bp、反向重复区(IRs)为26072 bp,序列已登录GenBank(OL435568).抱茎金花茶叶绿体基因组共预测注释134个基因,包括88个蛋白编码基因、38个tRNA基因、8个rRNA基因.叶绿体全基因组比较分析表明,抱茎金花茶结构与基因排序均保守,rps16、ycf3、ycf4-cemA、ycf15-trnL-CAA和rrn5-trnR-ACG序列可作为开发金花茶植物DNA条形码研究热点.抱茎金花茶cpDNA中共有67个SSR位点,其中单核苷酸、二核苷酸、三核苷酸、四核苷酸、六核苷酸重复数分别为48、4、1、11、2个.系统发育分析表明,抱茎金花茶在金花茶组中形成基部分支,和金花茶、显脉金花茶等互为姐妹类群,具有较近的亲缘关系.
文献关键词：
抱茎金花茶;叶绿体基因组;亲缘关系;文库构建;序列比对;系统发育树
中图分类号：
作者姓名：
丁祥青;毕远洋;陈佳婷;向双;练芳松;李文芳;吴丽君;邹双全
作者机构：
福建农林大学园林学院,福建福州350002;福建农林大学林学院,福建福州350002;福建省洋口国有林场,福建南平353001;福建省林业科学研究院,福建福州350012
文献出处：
引用格式：
[1]丁祥青;毕远洋;陈佳婷;向双;练芳松;李文芳;吴丽君;邹双全-.抱茎金花茶(Camellia tienii)的叶绿体基因组特征分析)[J].江苏农业科学,2022(23):33-40
A类：
抱茎金花茶,tienii,OL435568,ycf15,rrn5
B类：
Camellia,叶绿体基因组,基因组特征,叶绿体全基因组,全基因组序列,重测序,序数,金花茶叶,组长,bp,四分体,分体结构,拷贝,LSC,SSC,重复区,IRs,登录,GenBank,蛋白编码,编码基因,tRNA,rRNA,基因组比较,基因排序,rps16,ycf3,ycf4,cemA,trnL,CAA,trnR,ACG,条形码,cpDNA,SSR,单核苷酸,六核,重复数,系统发育分析,金花茶组,基部,姐妹,类群,亲缘关系,文库构建,序列比对,系统发育树
AB值：
0.285531
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