典型文献
苦马豆叶绿体基因组结构及其特征分析
文献摘要:
利用Illumina高通量测序平台对苦马豆(Sphaerophysa salsula)进行测序和组装,获得完整的苦马豆叶绿体基因组序列.组装结果表明,苦马豆叶绿体基因组全长123327 bp,存在IR区丢失,不具有四分体结构;注释结果显示,苦马豆叶绿体基因组共编码108个基因,其中包含74个蛋白编码基因、4个rRNA基因和30个tRNA基因;叶绿体基因组序列上共检测到99个SSR位点,包含75个单核苷酸、17个二核苷酸和7个三核苷酸重复单元;系统发育分析显示,苦马豆和骆驼刺为姊妹群,亲缘关系最近.这为今后苦马豆遗传多样性、群体遗传结构和物种形成机制研究奠定了基础.
文献关键词:
苦马豆;叶绿体基因组;简单重复序列;密码子偏好性;系统发育
中图分类号:
作者姓名:
苏丹丹;刘玉萍;刘涛;郑长远;张雨;王亚男;秦娜;苏旭
作者机构:
青海师范大学生命科学学院,西宁 810008;青海师范大学青海省青藏高原药用动植物资源重点实验室,西宁 810008;高原科学与可持续发展研究院,西宁 810016
文献出处:
引用格式:
[1]苏丹丹;刘玉萍;刘涛;郑长远;张雨;王亚男;秦娜;苏旭-.苦马豆叶绿体基因组结构及其特征分析)[J].植物研究,2022(03):446-454
A类:
Sphaerophysa,salsula
B类:
苦马豆,豆叶,叶绿体基因组,基因组结构,Illumina,高通量测序平台,基因组序列,基因组全长,bp,四分体,分体结构,蛋白编码,编码基因,rRNA,tRNA,列上,SSR,单核苷酸,系统发育分析,骆驼刺,姊妹,亲缘关系,遗传多样性,群体遗传结构,物种形成,简单重复序列,密码子偏好性
AB值:
0.269188
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