典型文献
陕甘花楸叶绿体基因组及其与爪瓣花楸的系统关系
文献摘要：
采用高通量测序技术分析了陕甘花楸(Sorbus koehneana)的叶绿体全基因组,并探讨其与爪瓣花楸(S.unguiculata)的关系.陕甘花楸叶绿体基因组全长159 873 bp,GC含量为36.60％,呈典型的四分体结构,包含1个小单拷贝区(SSC,19 218 bp),1个大单拷贝区(LSC,87 899 bp)和1对反向重复序列(IRa和IRb,26 378 bp);共注释到108个基因,包括76个蛋白编码基因,4个rRNA基因,28个tRNA基因;检测到47个简单重复序列(SSR)和48个分散重复序列(INE).花楸属植物叶绿体基因组在大小、基因类型、密码子、内含子和GC含量等方面高度保守,但不同的重复序列和位于非编码区的12个变异热点区域可用作后续物种遗传多样性和亲缘关系研究.系统发育分析结果显示陕甘花楸位于花楸属复叶亚属,与爪瓣花楸和钝齿花楸(S.helenae)亲缘关系较近;不支持将爪瓣花楸作为陕甘花楸的异名处理,建议恢复爪瓣花楸物种名称.
文献关键词：
花楸;叶绿体基因组;基因组比较;系统演化分析
中图分类号：
作者姓名：
汤晨茜;仇志欣;檀超;钱羽铭;陈昕
作者机构：
南京林业大学生物与环境学院,南方现代林业协同创新中心,南京210037
文献出处：
引用格式：
[1]汤晨茜;仇志欣;檀超;钱羽铭;陈昕-.陕甘花楸叶绿体基因组及其与爪瓣花楸的系统关系)[J].园艺学报,2022(03):641-654
A类：
koehneana
B类：
陕甘,叶绿体基因组,高通量测序技术,Sorbus,叶绿体全基因组,unguiculata,基因组全长,bp,四分体,分体结构,拷贝,SSC,LSC,IRa,IRb,蛋白编码,编码基因,rRNA,tRNA,简单重复序列,SSR,INE,花楸属,植物叶,基因类型,密码子,内含子,非编码区,热点区域,物种遗传多样性,和亲,亲缘关系,系统发育分析,复叶,helenae,不支,异名,基因组比较,系统演化分析
AB值：
0.36779
相似文献
机标中图分类号，由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成，仅供学习研究参考。
