典型文献
新疆野苹果与'元帅''金冠'的叶绿体基因组比对研究
文献摘要:
新疆野苹果(Malus sieversii)被认为是现代栽培苹果的祖先物种.为有效保护苹果遗传资源,揭示新疆野苹果和栽培苹果叶绿体基因组的差异,验证现代栽培苹果是否起源于新疆野苹果.对新疆野苹果和栽培苹果'元帅'和'金冠'的叶绿体全基因组进行了测序、组装和注释,获得了其叶绿体基因组物理图谱,并进行了比较基因组分析和系统发育分析.结果表明,新疆野苹果和两个栽培苹果品种的叶绿体基因组均为四段式结构,其基因组总长度在160 068~160 288 bp之间;共注释出131个基因,其中蛋白编码基因86个,tRNA基因37个,rRNA基因8个;新疆野苹果与栽培苹果的碱基组成也基本相似,AT/GC含量基本相同;新疆野苹果鉴定出43个重复序列和64个简单重复序列位点,栽培品种'元帅'鉴定出49个重复序列和61个简单重复序列位点,'金冠'鉴定出43个重复序列和57个简单重复序列位点.系统发育分析结果表明:基于全序列构建的贝叶斯进化树在各个节点具有很高的支持率,苹果属的所有物种形成一个单系群(支持率100%),新疆野苹果和两个栽培苹果品种聚在一起,形成一个小分支(支持率100%),且新疆野苹果位于该小分支的基部,验证了新疆野苹果是栽培苹果的祖先物种的推断.
文献关键词:
新疆野苹果;叶绿体基因组;差异分析;系统发育
中图分类号:
作者姓名:
丁志杰;包金波;柔鲜古丽;朱甜甜;李雪丽;苗浩宇;田新民
作者机构:
新疆大学生命科学与技术学院,新疆生物资源基因工程重点实验室,乌鲁木齐830046
文献出处:
引用格式:
[1]丁志杰;包金波;柔鲜古丽;朱甜甜;李雪丽;苗浩宇;田新民-.新疆野苹果与'元帅''金冠'的叶绿体基因组比对研究)[J].园艺学报,2022(09):1977-1990
A类:
B类:
新疆野苹果,元帅,金冠,叶绿体基因组,比对研究,Malus,sieversii,祖先,遗传资源,苹果叶,叶绿体全基因组,比较基因组分析,系统发育分析,苹果品种,四段,段式,式结构,总长度,bp,释出,蛋白编码,编码基因,tRNA,rRNA,碱基组成,AT,基本相同,简单重复序列,列位,栽培品种,全序,进化树,支持率,苹果属,所有物,物种形成,单系群,聚在一起,果位,基部
AB值:
0.24341
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