典型文献
胶孢炭疽菌侵染不同抗性葡萄叶片的转录组学分析
文献摘要：
[目的]通过转录组测序筛选葡萄由胶孢炭疽菌侵染引起的差异表达基因,以进一步分析葡萄抗炭疽病分子机制.[方法]用胶孢炭疽菌侵染不同抗性葡萄的叶片,以清水处理叶片为对照,设置0、24、48、72 h 4个时期取样.采用RNA-seq分析两者间的差异表达基因,挑选出抗病候选基因,并利用qRT-PCR进行验证.[结果]共对42个样品进行转录组测序,每个样品平均数据量为6.65 Gb.KEGG富集分析中差异表达基因主要集中在植物与病原体互作、类黄酮生物合成和MAPK信号途径;转录因子家族分析从MYB、AP2-EREBP、bHLH、NAC和WRKY家族中筛选出12个在抗病株系中高表达的差异表达基因;WGCNA得到抗病相关模块Medarkgreen.综合各项分析,挑选出9个差异表达基因进行qRT-PCR验证,其中8个基因的表达趋势同转录组测序结果一致.[结论]获得了葡萄响应胶孢炭疽菌侵染的差异表达基因,显著富集在植物与病原体相互作用、类黄酮生物合成和MAPK信号途径等3个通路,并筛选出8个抗病候选基因,包括MLO蛋白,WRKY、ERF转录因子等.
文献关键词：
葡萄炭疽病;转录组;胶孢炭疽菌;差异表达基因
中图分类号：
作者姓名：
沈才琦;孙磊;张颖;姜建福;刘崇怀;樊秀彩
作者机构：
中国农业科学院郑州果树研究所,郑州450009
文献出处：
引用格式：
[1]沈才琦;孙磊;张颖;姜建福;刘崇怀;樊秀彩-.胶孢炭疽菌侵染不同抗性葡萄叶片的转录组学分析)[J].果树学报,2022(05):730-742
A类：
Medarkgreen
B类：
胶孢炭疽菌,侵染,葡萄叶片,转录组学分析,转录组测序,差异表达基因,seq,挑选出,候选基因,qRT,共对,平均数,数据量,Gb,富集分析,病原体,类黄酮,生物合成,MAPK,信号途径,家族分析,MYB,AP2,EREBP,bHLH,NAC,WRKY,病株,株系,WGCNA,MLO,ERF,葡萄炭疽病
AB值：
0.280749
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